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quavavav

新虫 (初入文坛)

[求助] 势能面扫面结果出问题 不明原因 求助

故事是我想做两个堆叠起来的环状分子的势能面扫描(Relaxed Scan),扫描对象是两个环状分子间的旋转角。因为分子的原子数目有些多,所以先拿两个上下堆叠的苯环试一试。

起始设置:两个苯环上下对齐 间距5个单位长度。两苯环中心各有一个Bq原子做旋转的参考轴。固定了一些角度,使两个苯环一直处于平行状态。下面是输入文件。

模拟的结果是两个苯环相互远离,远离至少30个单位后才停下。然后体系按照预定,二面角开始旋转。我不理解这个结果为何这样,难道不应该停在差不多3-5埃的距离后就达到能量最低状态了吗,为什么两个苯分子会离开有近30几个埃的距离呢。

%chk=benzenescan.chk
%nprocshared=16
%mem=20GB
# opt=modredundant hf/6-31g(d) nosymm

Title Card Required

0 1
C                  2.66038781    4.38959164    0.50000000
C                  1.45229046    3.69209631    0.50000000
C                  1.45229046    2.29710564    0.50000000
C                  2.66038781    1.59961031    0.50000000
C                  3.86848517    2.29710564    0.50000000
C                  3.86848517    3.69209631    0.50000000
H                  2.66038781    5.48920195    0.50000000
H                  0.50000000    4.24190146    0.50000000
H                  0.50000000    1.74730049    0.50000000
H                  2.66038781    0.50000000    0.50000000
H                  4.82077563    1.74730049    0.50000000
H                  4.82077563    4.24190146    0.50000000
Bq                 2.66038781    2.99460097    0.50000000
C                  2.66038781    4.38959164    5.50000000
C                  1.45229046    3.69209631    5.50000000
C                  1.45229046    2.29710564    5.50000000
C                  2.66038781    1.59961031    5.50000000
C                  3.86848517    2.29710564    5.50000000
C                  3.86848517    3.69209631    5.50000000
H                  2.66038781    5.48920195    5.50000000
H                  0.50000000    4.24190146    5.50000000
H                  0.50000000    1.74730049    5.50000000
H                  2.66038781    0.50000000    5.50000000
H                  4.82077563    1.74730049    5.50000000
H                  4.82077563    4.24190146    5.50000000
Bq                 2.66038781    2.99460097    5.50000000

A 16 26 13 F
A 3 13 26 F
A 18 26 13 F
A 5 13 26 F
A 14 26 13 F
A 1 13 26 F
D 16 26 13 3 S 6 10.000000
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