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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP过渡态数据处理
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liuqun

木虫 (小有名气)

[求助] VASP过渡态数据处理

已经用CIneb计算出结果了，也用nebresults.pl处理了结果了，可是不会看生成的那些文件，哪位大师能指点一下我呢
1. 找到的过渡态怎么计算频率来确定找到的就是过渡态呢？
2. 用脚本处理后的结果，怎么才能做出一张图呢，就是有反应物中间过渡态，后边产物的那个图。
    必有重谢！
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1楼 2012-05-23 10:02:08
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tangtiecheng

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
16楼: Originally posted by liuqun at 2012-05-29 08:05:25
恩，是这样的，在00 和05里放入OUTCAR后就能正常运行了，谢谢...

你好，我想请教一个问题，之前用nebbarrier.pl产生了neb.dat文件，结果我用nebspline.pl这个脚本时会提示错误，
Illegal division by zero at nebspline.pl line 64.
我的neb.bat是这样的

  0     0.000000     0.000000     0.000000   0
  1     0.000000    -0.009942    -0.003256   1
  2     0.000000    -0.009604    -0.005472   2
  3     0.000000    -0.008170    -0.009533   3
  4     0.000000    -0.005533    -0.006096   4
  5     0.000000    -0.007845     0.003240   5
  6     0.000000    -0.008629     0.003238   6
  7     0.000000    -0.008943     0.000690   7
  8     0.000000    -0.008635     0.005036   8
  9     0.000000    -0.010654     0.013634   9
10     0.000000    -0.013394     0.012849  10
11     0.000000    -0.015259     0.002361  11
12     0.000000    -0.009934     0.007339  12
13     0.000000    -0.010585     0.000000  13
不知道你有没有遇到过相同的问题。这个不知道该怎么解决
赞一下 回复此楼
17楼2012-06-04 21:22:40
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
liuqun: 金币+60, ★有帮助 2012-05-23 12:52:36
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-05-23 13:23:46
处理后有一mep.eps的文件，这个文件可以用photoshop去看。
如果想手动作图有一个spline.dat的文件可以用Origin等作图软件作图。spline.dat有四列，我一般作图取的是第一列（横坐标）和第三列（纵坐标）就和mep.eps的图像是一致的。
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liuqun
2楼2012-05-23 10:38:08
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liuqun

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-05-23 10:38:08
处理后有一mep.eps的文件，这个文件可以用photoshop去看。
如果想手动作图有一个spline.dat的文件可以用Origin等作图软件作图。spline.dat有四列，我一般作图取的是第一列（横坐标）和第三列（纵坐标）就和mep.eps ...

你好：
    我刚发现用脚本只能处理几个image中的一个，我是用nebresult.
pl 01这样处理的，不知道对不对，能不能一块把几个images一块处理了呢？把这几个images的能量一块生成一个文件夹
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3楼2012-05-27 07:45:52
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likai0106

金虫 (小有名气)
★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-05-27 09:43:57
引用回帖:
3楼: Originally posted by liuqun at 2012-05-27 07:45:52
你好：
    我刚发现用脚本只能处理几个image中的一个，我是用nebresult.
pl 01这样处理的，不知道对不对，能不能一块把几个images一块处理了呢？把这几个images的能量一块生成一个文件夹...

一般来说当你直接输入nebresult.pl后，输出结果会把01 ....0n结合起来处理成一个势能曲线和一些能垒分析的数据。
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liuqun
4楼2012-05-27 08:15:09
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