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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 离子液体能做分子对接和分子动力学吗
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cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[求助] 离子液体能做分子对接和分子动力学吗

离子液体和酶的结合能做分子对接吗？能做分子动力学吗？由于是由阴离子和阳离子组成的，用什么力场比较合适呢？
另外，求离子液体和酶结合的分子模拟的相关文献
谢谢
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1楼 2012-05-23 09:59:08
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-23 22:23:48
cfmzxf84: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-05-24 09:54:32
http://muchong.com/html/201203/4217112.html

重点是看俺的回复咯。
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2楼2012-05-23 22:20:04
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cfmzxf84

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yalefield at 2012-05-23 22:20:04:
http://muchong.com/html/201203/4217112.html

重点是看俺的回复咯。

谢谢顾问，在那个帖子也请教了您
我也看了那些文章，都没有做离子液体和酶的动力学。
离子液体的参数文件不知道怎么做啊，比如AMBER。谢谢
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3楼2012-05-23 23:17:06
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
引用回帖:
3楼: Originally posted by cfmzxf84 at 2012-05-23 23:17:06:
谢谢顾问，在那个帖子也请教了您
我也看了那些文章，都没有做离子液体和酶的动力学。
离子液体的参数文件不知道怎么做啊，比如AMBER。谢谢

(*^__^*) 嘻嘻……，俺也不知道。俺不当这个顾问。
俺是说不当这个问题的顾问了。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

cfmzxf84
4楼2012-05-24 00:44:34
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cfmzxf84

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by yalefield at 2012-05-24 00:44:34:
(*^__^*) 嘻嘻……，俺也不知道。俺不当这个顾问。
俺是说不当这个问题的顾问了。

呵呵，谢谢顾问友情顶帖
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5楼2012-05-24 09:55:04
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cfmzxf84: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢啊，我去看看 2012-05-24 11:47:19
引用回帖:
5楼: Originally posted by cfmzxf84 at 2012-05-24 09:55:04:
呵呵，谢谢顾问友情顶帖

http://www.sciencedirect.com/sci ... i/S0896844612001635
看看这篇文献，这人是拿GROMACS跑的，离子液体的参数使用gaussian拟合出来的
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6楼2012-05-24 10:38:53
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
引用回帖:
6楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-05-24 10:38:53:
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0896844612001635
看看这篇文献，这人是拿GROMACS跑的，离子液体的参数使用gaussian拟合出来的

嗯，又是伊朗人。
按照CCTV中张某将军的说法，为了伊朗，中国不在乎第三次世界大战，何况离子液体的分子立场。
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7楼2012-05-24 11:43:25
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