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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 微米和纳米 » 微纳器件 » 请教如何判断aptamer是否有效？
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padodo

至尊木虫 (职业作家)

胖嘟嘟

优秀版主

[求助] 请教如何判断aptamer是否有效？

大家好，我最近做一个关于aptamer的实验，是用纳米粒子对荧光修饰的aptamer的荧光淬灭，然后在分析物存在下荧光回复。
但是试验中，增加分析物浓度也始终不能使荧光回复，不知道问题所在。我怀疑是我的aptamer有问题，不知道大家有没有什么好方法验证到手的FAM-aptamer的序列正确性 ？
我的aptamer是上海生工合成的。
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我有什么能帮助您的吗？
1楼 2012-05-22 23:15:01
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更深的蓝

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
padodo: 金币+7, ★★★很有帮助, 很高很高的建议！ 2012-05-23 21:39:12
padodo: 回帖置顶 2012-05-23 21:39:58
你换种方式，先让aptamer与分析物结合，再加纳米颗粒。
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低调务实！
11楼2012-05-23 20:29:19
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普通回帖

sally208

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
padodo: 金币+10, ★★★很有帮助, 呵呵，你要是在国内，我就一个电话打过来问你了^.^ 2012-05-23 08:56:08
有否可能aptamer与分析物结合后仍吸附在纳米粒子表面，这样的话荧光没有恢复就能理解了。
此外，我没理解错的话，你这个sensor的设计前提在于aptamer能吸附在纳米粒子表面，从而导致荧光淬灭，对此有否实验证明？如果不是static quenching, 而是碰撞引起的dynamic quenching，嘿嘿，你也得考虑一下了。
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2楼2012-05-23 05:04:50
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mlanqiang

木虫之王 (文学泰斗)

蓝博士

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
padodo: 金币+3, ★有帮助, 谢谢！ 2012-05-23 08:56:20
适配子与分析物结合后，可能还吸附在粒子表面。
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蓝精灵
3楼2012-05-23 06:36:30
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padodo

至尊木虫 (职业作家)

胖嘟嘟

优秀版主
引用回帖:
2楼: Originally posted by sally208 at 2012-05-23 05:04:50:
有否可能aptamer与分析物结合后仍吸附在纳米粒子表面，这样的话荧光没有恢复就能理解了。
此外，我没理解错的话，你这个sensor的设计前提在于aptamer能吸附在纳米粒子表面，从而导致荧光淬灭，对此有否实验证明？如

sally兄，你说的这个情况我也是考虑着，如果是你那种荧光内滤导致的淬灭，那就不会有荧光恢复了。
问题在于我只是重复了一个文献（JACS）的实验，但是做不出他的现象。。。
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我有什么能帮助您的吗？
4楼2012-05-23 08:52:49
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padodo

至尊木虫 (职业作家)

胖嘟嘟

优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by mlanqiang at 2012-05-23 06:36:30:
适配子与分析物结合后，可能还吸附在粒子表面。

有可能，如果是这样的话那还有什么改进的方案呢？
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5楼2012-05-23 08:53:21
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xugehui

铁杆木虫 (著名写手)

general
引用回帖:
4楼: Originally posted by padodo at 2012-05-23 08:52:49:
sally兄，你说的这个情况我也是考虑着，如果是你那种荧光内滤导致的淬灭，那就不会有荧光恢复了。
问题在于我只是重复了一个文献（JACS）的实验，但是做不出他的现象。。。

个人感觉很多实验是重复不来的，我看文献的时候，每次看到aptamer吸附到石墨烯上面，然后加入什么物质去吸附的文章，我就心里打鼓，这个去吸附个人感觉还蛮不容易的吧。但是aptamer一般不容易失活的，楼主在重新考虑一下其他可能因素。
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宇智波-鼬~美到极致是疯狂~
6楼2012-05-23 11:00:58
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padodo

至尊木虫 (职业作家)

胖嘟嘟

优秀版主
引用回帖:
6楼: Originally posted by xugehui at 2012-05-23 11:00:58:
个人感觉很多实验是重复不来的，我看文献的时候，每次看到aptamer吸附到石墨烯上面，然后加入什么物质去吸附的文章，我就心里打鼓，这个去吸附个人感觉还蛮不容易的吧。但是aptamer一般不容易失活的，楼主在重新考

谢谢！我也觉得这个竞争力可能不够，很难下来，但是人家发了JACS至少现象应该还是存在的吧。。。
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7楼2012-05-23 12:01:03
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xugehui

铁杆木虫 (著名写手)

general
引用回帖:
7楼: Originally posted by padodo at 2012-05-23 12:01:03:
谢谢！我也觉得这个竞争力可能不够，很难下来，但是人家发了JACS至少现象应该还是存在的吧。。。

姑且相信他们的实验结果~~~
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宇智波-鼬~美到极致是疯狂~
8楼2012-05-23 12:23:31
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sally208

专家顾问 (著名写手)
Anyway, good luck!
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9楼2012-05-23 13:50:24
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padodo

至尊木虫 (职业作家)

胖嘟嘟

优秀版主
引用回帖:
9楼: Originally posted by sally208 at 2012-05-23 13:50:24:
Anyway, good luck!

呵呵，谢谢！
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10楼2012-05-23 14:56:10
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