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x-cool

金虫 (小有名气)

[求助] 求助配合物的对接

求助:
   本人才学分子模拟不久,想用Sybyl8.0做金属离子配合物与蛋白质的对接。
有几个问题想请教一些:
(1)在Sybyl8.0里如何画配位键,如果不能画,用什么软件可以替代。
(2)优化金属粒子配合物用什么立场。
希望各位高手指点。

[ Last edited by x-cool on 2012-5-21 at 18:05 ]
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x-cool
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lin_lin_lin

新虫 (初入文坛)

★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-11 13:52:18
用leadit 的flexx 对接,离子配合物的构型都能清楚的展示出来。flexx 有专门的分析金属离子与蛋白复合物的相互作用的算法。你可以上这个网站申请试用www.cloudscientific.com
3楼2012-06-11 10:37:31
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郝明

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-08 20:44:33
试试chimera 我在sybyl里做蛋白质 都会用这个处理图 作图比较漂亮比较强大
希望对你有帮助
2楼2012-06-07 15:26:50
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