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821078607

银虫 (小有名气)

[求助] RNA电泳

各位高手大家好,新手在此请教几个问题, 希望各位不吝赐教
请问我从细胞中提取出来的RNA经反转录用于后续PCR,要确定它的完整性,除了测OD值还要进行电泳表征吗?
另外,测吸收时全部都要用DECP水吗?一定要用甲醛变性琼脂糖凝胶电泳吗,所有电泳时的溶液包括电泳缓冲夜、载样液等都要用DECP水吗,电泳槽要经特殊处理吗?
我测RNAOD值时用普通二次水稀释后,测其OD值为1.875,是不是说明只测吸收不能说明RNA的完整性?
先谢谢大家!
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kuaile-RJ

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助,谢谢分享经验 2012-05-21 17:22:34
821078607: 金币+4, 有帮助, 谢谢~~ 2012-05-21 22:23:42
呵呵,我也是个新手,特别是对于细胞核酸的提取来说。我提植物组织的核酸较多。在此说一下我的感受。
1.RNA提取出来要验证其完整性,一般是通过测OD和跑电泳结合来看,OD260/OD280在1.6-2.0都可以,跑胶的话跑个普通的琼脂糖凝胶就可以了,主要是28s和18s的亮度,5s一般不能太亮,否则大都是降解了
2.测OD时稀释和空白最好用你溶RNA的液体,这样测得的结果才比较准确。电泳时电泳缓冲液和载样液其实也不用DEPC,不过最好换新鲜的电泳液。电泳槽拿纯净水冲冲就可以。跑胶过程比较快,RNA在此过程中也没么快降解。
3.只测OD260不能说明其完整性,但可以计算其浓度。

以上是个人实验的感受和经验,如有不对的地方还请指教,希望对你有所帮助!
3楼2012-05-21 01:17:31
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cheng_xiao

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-20 18:51:35
821078607: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-23 22:00:39
溶解RNA是用DEPC水,别的地方不用,电泳不用变性也可以,OD值为1.875已经很好了,虽然RNA易降解,但也不用这么小心
我努力我奋斗我成功
2楼2012-05-20 17:16:20
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xiaotianxin

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
821078607: 金币+2, 有帮助, 谢谢 2012-05-21 22:23:58
溶解RNA用DEPC水,跑电泳用普通的就可以,但是跑电泳能用到的所有东西都用75%酒精擦拭一遍,电泳buffer换新的即可。
4楼2012-05-21 10:53:19
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longrna

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-21 17:22:48
821078607: 金币+2, 有帮助 2012-05-21 22:24:37
百度一下提取RNA的操作或注意事项。
1、提取过程所用到的试剂或器皿均应无RNase污染。具体的去RNase可百度,随处可见。
2、溶解RNA肯定需要用DEPC水(0.1%DEPC处理过然后高压灭菌,或直接购买DEPC-Water(RNase-free)).
3、一般的实验要求测OD及跑电泳。测DOD
伟大航线....
5楼2012-05-21 11:09:46
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