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546672286

金虫 (著名写手)

[求助] 晶体中CIF的错误

希望各位高手帮忙解决一下我的晶体A,B类错误,不胜感激
Alert level A
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        299 A**3
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
PLAT342_ALERT_3_B Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............     0.0783 Ang  
PLAT411_ALERT_2_B Short Inter H...H Contact  H3B    ..  H3B     ..       1.98 Ang.
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sdujjt

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
见证2011: 金币+1, 欢迎常来! 2012-05-19 11:33:51
fds329: 金币+1, 欢迎常来 2012-05-21 08:51:22
第一个问题是有空腔,可用platon计算,第二个是在ins中加damp命令,第三个问题不大,限制一下键长
生命像一条大河
2楼2012-05-19 10:49:27
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waldenburgcn

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fds329: 金币+2, 感谢应助。辛苦了O(∩_∩)O 2012-05-21 08:51:25
第一个A类错误做个squeeze就好了。
3楼2012-05-20 21:01:52
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546672286

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sdujjt at 2012-05-19 10:49:27:
第一个问题是有空腔,可用platon计算,第二个是在ins中加damp命令,第三个问题不大,限制一下键长

你好,第一个问题能不能具体说明一下?第二个和第三个我也用了你说的命令,可是还不行啊? damp 5000 和 dfix 3.0 0.01 h3B h3B 对吗?谢谢指导
4楼2012-05-21 09:01:51
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546672286

金虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by waldenburgcn at 2012-05-20 21:01:52:
第一个A类错误做个squeeze就好了。

可以具体一点?我是初学者,谢谢
5楼2012-05-21 09:03:41
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546672286

金虫 (著名写手)

你好,这个platon检测的结构,你看看该往INS里输些什么谢谢

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  • 附件 1 : platon_screen.txt
  • 2012-05-21 09:44:02, 22.56 K
6楼2012-05-21 09:44:50
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