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a123hu3075

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 用MS计算氢键键能为什么结果为负值?

这是用ms计算出的晶体内氢键键能的值,在这里有两个问题向大家请教:一是,计算这个氢键的键能值为什么为负值?二是,该值单位是Kcal/mol,因此想问每mol 指的是每摩尔晶体中氢键键能的值还是每摩尔氢键键能的值?谢谢!!!
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青菜001

金虫 (小有名气)


chaizhm: 金币+1, 补充清楚大家更有针对性 2012-05-18 23:03:06
顶,同求解答,楼主能不能把信息再补充的详细一点,譬如用什么模块做的,用来做什么的等等方面的信息
有问题可以私下里探讨,1986319688@qq.com
2楼2012-05-18 22:17:12
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a123hu3075

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 青菜001 at 2012-05-18 22:17:12:
顶,同求解答,楼主能不能把信息再补充的详细一点,譬如用什么模块做的,用来做什么的等等方面的信息

用forcite,做水合物方面的
3楼2012-05-19 10:10:24
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hedonistful

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-19 23:14:44
引用回帖:
3楼: Originally posted by a123hu3075 at 2012-05-19 10:10:24:
用forcite,做水合物方面的

LZ,你看看能不能把模型里的H键数量与你的模型匹配起来,就是说不要过多的H键。另外我想问你,你计算了H键的参数,能不能计算H的同位素D键的参数呢?我玩MS不是很多。
君子豹变≡≡大人虎变≡≡小人革面。
4楼2012-05-19 22:14:05
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a123hu3075

铁杆木虫 (著名写手)


chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-24 22:07:47
引用回帖:
4楼: Originally posted by hedonistful at 2012-05-19 22:14:05:
LZ,你看看能不能把模型里的H键数量与你的模型匹配起来,就是说不要过多的H键。另外我想问你,你计算了H键的参数,能不能计算H的同位素D键的参数呢?我玩MS不是很多。

我计算 了一下两者的氢键数量是没有变化的。关于是否能够计算同位素这个我也不太清楚,目前还没有做过这方面的计算。你可以试一下看看行不行
5楼2012-05-20 10:00:39
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独处静隅

金虫 (小有名气)

楼主是怎么用MS计算氢键键能的?求指导。。。有相关教程吗?
6楼2012-05-24 21:04:28
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猫头鹰love

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

麻烦问一下,楼主你的问题解决没?想请教一下楼主是怎么算的氢键键能的?用的是Forcite模块吗?能不能详细说下啊?非常感谢!另外不知道楼主对于用MS计算氢键的数量的时候,具体设置氢键的键长键角有啥要求啊?是键长最大值为2.5,键角要大于90°吗?请赐教啊,谢谢。
7楼2013-04-08 15:44:09
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Aimer蕾蕾

金虫 (正式写手)

最近也在学习MS软件计算氢键的事情,不知道怎么建立模型,另外我计算出来的氢键键能有正有负,求解
青春,为未来!
8楼2014-06-24 11:30:41
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小虫_sang

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by Aimer蕾蕾 at 2014-06-24 11:30:41
最近也在学习MS软件计算氢键的事情,不知道怎么建立模型,另外我计算出来的氢键键能有正有负,求解

你好,最近我也在想如何利用MS计算出结构中氢键的键能问题。听说Forcite模块中的dreiding力场中考虑了氢键作用,我就用该力场优化了结构发现氢键键能最后为负值????你的问题解决了吗?
9楼2015-02-09 17:18:39
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yz1992yz

新虫 (小有名气)

楼主你好,我也做水合物方面的,麻烦问一下,你的水模型是不是在cvff力场下的spc或者tip模型,氢键是怎样得到的?、
10楼2015-12-25 09:17:06
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