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用OPLS力场模拟环己酮
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用Gromacs模拟环己酮，想用OPLS力场，OPLS原子编号好像选的有问题，改了很多都不对，自己写的ITP文件（部分）如下： ; nr type resnr residue atom cgnr charge 1 opls_136 1 CYC C 1 0.00800 2 opls_136 2 CYC C 1 -0.24600 3 opls_280 3 CYC C 1 0.51100 4 opls_136 4 CYC C 1 -0.25300 5 opls_136 5 CYC C 1 0.00800 6 opls_136 6 CYC C 1 -0.24000 7 opls_281 6 CYC O 1 -0.47300 8 opls_140 6 CYC H 1 0.03600 9 opls_140 6 CYC H 1 0.05400 10 opls_140 6 CYC H 1 0.08900 11 opls_140 6 CYC H 1 0.08000 12 opls_140 6 CYC H 1 0.08200 13 opls_140 6 CYC H 1 0.09100 14 opls_140 6 CYC H 1 0.05500 15 opls_140 6 CYC H 1 0.03700 16 opls_140 6 CYC H 1 0.06800 17 opls_140 6 CYC H 1 0.09300 本人是初学者，还请哪个大牛帮忙看看，哪个原子选的不对？谢谢了 |
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