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people2416

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 求助 画单晶椭球图,堆积图和结构图

本人是做有机合成的,有一个单晶,想发Acta E ,用DIAMOND 画了,但是本人对单晶这一方面不太了解,确实能力有限,希望高手帮我画个单晶椭球图,堆积图和结构图,届时我愿意再奉上50金币,真的很着急,请高手帮帮忙,可以的话给我留个邮箱吧,我把CIF文件发给你,非常感谢!!!
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桃园结义

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你下个XP吧(我说的是画晶体的XP)
命令我给你:
比如,把你的   **.ins  文件  复制后, 命名成简单的  1.ins放在一个新建文件夹里面。
另外把XP放在1.ins同样一个文件夹里面
下面就是配位环境图命令(注意空格键)
read 1
fmol less $Q
kill $H(可选,删除H原子,使得某些情况下结构简单明了)
uniq M1(M代表配位的金属,1代表晶体学上独立的金属原子序号为1)
grow
pick(可选,删除一些不必要的键)
mpln/n(可选,把晶体位置放在最小重叠的位置)
proj(关键命令,得到结构图后,可以通过右上的命令调整具体视角)
labl 1 450 (可选,标注晶体结构原子序数)
telp 0-30 0.05(可选,画晶体结构椭球形,并标注球模型大小)
telp多次后出现一个plt,这是要求你命名的,比如说1
然后
draw 1
出现很多选项,一般选a (变成可以用PhotoShop打开的文件)
出现颜色选项注意空格后在c
就OK了

堆积图
read 1
fmol less $Q
kill $H
grow
matr 1(1代表从a方向,也即使bc轴看的晶体堆积图,2代表b,3代表c)
pbox 15 4(定义堆积图格子大小,一般是15 4)
pack(显示堆积图,并用右上的命令删除不想要的重复单元和一些游离溶剂分子,弄好了后记得用右边最下的那个命令保存下)
telp cell(显示画好的堆积图)
出现plt后命名,比如a
draw a
空格 c


这样配位图和堆积图就基本上画好了,当然,要想画好看点的可以使用其他软件,XP只能大概的看看。我懂得就这么多,欢迎懂得人交流下经验哦~
13楼2012-05-18 11:49:04
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hjh509

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 欢迎回帖交流 2012-05-15 23:07:18
如果你能等的话,发给我,我明晚才有时间!hjh509@swu.edu.cn
另外,说下你具体的要求!

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111
2楼2012-05-15 21:50:57
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moonbear

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 欢迎回帖交流 2012-05-15 23:07:28
我可以试试,wjy090202@yahoo.com.cn.
光CIF文件不行,还要其他的文件.
3楼2012-05-15 21:51:20
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moonbear

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不好意思,邮箱是wjy090202@yahoo.com.
4楼2012-05-15 22:13:06
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