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people2416铁杆木虫 (正式写手)
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[求助]
求助 画单晶椭球图,堆积图和结构图
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| 本人是做有机合成的,有一个单晶,想发Acta E ,用DIAMOND 画了,但是本人对单晶这一方面不太了解,确实能力有限,希望高手帮我画个单晶椭球图,堆积图和结构图,届时我愿意再奉上50金币,真的很着急,请高手帮帮忙,可以的话给我留个邮箱吧,我把CIF文件发给你,非常感谢!!! |
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桃园结义
木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
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你下个XP吧(我说的是画晶体的XP) 命令我给你: 比如,把你的 **.ins 文件 复制后, 命名成简单的 1.ins放在一个新建文件夹里面。 另外把XP放在1.ins同样一个文件夹里面 下面就是配位环境图命令(注意空格键) read 1 fmol less $Q kill $H(可选,删除H原子,使得某些情况下结构简单明了) uniq M1(M代表配位的金属,1代表晶体学上独立的金属原子序号为1) grow pick(可选,删除一些不必要的键) mpln/n(可选,把晶体位置放在最小重叠的位置) proj(关键命令,得到结构图后,可以通过右上的命令调整具体视角) labl 1 450 (可选,标注晶体结构原子序数) telp 0-30 0.05(可选,画晶体结构椭球形,并标注球模型大小) telp多次后出现一个plt,这是要求你命名的,比如说1 然后 draw 1 出现很多选项,一般选a (变成可以用PhotoShop打开的文件) 出现颜色选项注意空格后在c 就OK了 堆积图 read 1 fmol less $Q kill $H grow matr 1(1代表从a方向,也即使bc轴看的晶体堆积图,2代表b,3代表c) pbox 15 4(定义堆积图格子大小,一般是15 4) pack(显示堆积图,并用右上的命令删除不想要的重复单元和一些游离溶剂分子,弄好了后记得用右边最下的那个命令保存下) telp cell(显示画好的堆积图) 出现plt后命名,比如a draw a 空格 c 这样配位图和堆积图就基本上画好了,当然,要想画好看点的可以使用其他软件,XP只能大概的看看。我懂得就这么多,欢迎懂得人交流下经验哦~ |
13楼2012-05-18 11:49:04







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