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helitrope

新虫 (小有名气)

[求助] 怎样构建合理的酶催化体系

本菜鸟想用量化的方法研究某种酶的催化机制,可是不知道应该怎样构建模型。请问各位前辈,怎样判断自己构建的体系是否合理 ?我的理解是,将构建好的模型进行优化,如果得到的构型和晶体结构相差不大,那么就可以认为构建的模型是合理的;如果得到的结构和晶体结构相差很大,那么这个模型是不合理的。
  不知道这样的理解合理吗?
  请问在构建计算模型的时候有没有什么标准?

[ Last edited by zhou2009 on 2012-5-13 at 16:11 ]
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liu108

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-05-15 21:02:21
helitrope: 金币+10 2012-05-19 08:59:27
首先你的这种理解是正确的,搭建模型是否合理要看优化后的结果再说,但是模型一定要预先建的合理,对于催化建模要先考虑好主体和次体。
会当凌绝顶,一览众山小。
2楼2012-05-15 20:29:01
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