24小时热门版块排行榜    

查看: 1942  |  回复: 12

egogg

木虫 (小有名气)

[交流] POSCAR的格式问题(vasp4与vasp5) 已有4人参与

看vasp官方文档上面POSCAR的格式是这样的:
1: Title                                         POSCAR
2: Scale                                       1.0
3: Vector_a                                 5.0  0.0  0.0
4: Vector_b                                 0.0  5.0  0.0
5: Vector_c                                 0.0  0.0  5.0
6: atom numbers                        4  5
7: Selective Dynamics                 Selective Dynamics
8: Coordinate Format                 Direct
9: Coordinates                           0.0 0.0 0.0   F F T
...

现在我忽然看到这样一种格式:

1: Title                                         POSCAR
2: Scale                                       1.0
3: Vector_a                                 5.0  0.0  0.0
4: Vector_b                                 0.0  5.0  0.0
5: Vector_c                                 0.0  0.0  5.0
6: Ion types                                C  H  O  N
7: atom numbers                        4  5
8: Selective Dynamics                 Selective Dynamics
9: Coordinate Format                 Direct
10: Coordinates                          0.0 0.0 0.0   F F T
...

这两种格式都可以用么?是vasp4和vasp5的区别么?vasp5的格式更新在官方文档的什么地方可以查找到?谢谢!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

first principle

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiongb123456

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
其实下面的那一种的第六行算不算是多余的呐?
因为你不管POSCAR怎么写
POTCAR里的赝势也是与前面的原子一类一类对应地
我可以这样理解吗?
2楼2012-05-11 15:08:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-05-11 15:08:03:
其实下面的那一种的第六行算不算是多余的呐?
因为你不管POSCAR怎么写
POTCAR里的赝势也是与前面的原子一类一类对应地
我可以这样理解吗?

我看到一些三方软件例如VMD,VESTA等等生成或读取的POSCAR格式都是下面的那一种,就是说它们都能解析第6行的离子类型。

就是不知道运算的时候能不能用下面的那一种,我自己一直是按照vasp手册上的方式把下面的那一种改成上面的。不知道有没有人用过下面的那一种格式。
3楼2012-05-11 15:15:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-05-15 20:15:20
这是vasp5.x和以前版本的区别,
不过对于以前的格式5.x兼容,
也就是说只要是用5.x的版本的两种格式都可以正常使用
4楼2012-05-11 15:17:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-05-11 15:17:51:
这是vasp5.x和以前版本的区别,
不过对于以前的格式5.x兼容,
也就是说只要是用5.x的版本的两种格式都可以正常使用

谢谢回复,确认这两种格式都能用么?不知道哪儿有官方的文档?
5楼2012-05-11 15:21:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by egogg at 2012-05-11 15:21:03:
谢谢回复,确认这两种格式都能用么?不知道哪儿有官方的文档?

用个例子试一下就可以了啊,没那么复杂啊,呵呵
6楼2012-05-11 15:33:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiongb123456

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by egogg at 2012-05-11 15:15:21:
我看到一些三方软件例如VMD,VESTA等等生成或读取的POSCAR格式都是下面的那一种,就是说它们都能解析第6行的离子类型。

就是不知道运算的时候能不能用下面的那一种,我自己一直是按照vasp手册上的方式把下面的 ...

按你这么说 我试了一下自己平时写的POSCAR
我的POSCAR都是按照第一种那样写的
没有表明是什么元素 按照这个说法 我用VMD打开这个POSCAR时
不是应该显示不出我打开的这个结构上分别是什么原子吗?
不是按理来说应该是全部一样的原子吗?只是结构摆在那里而已

可是 奇怪的事情是 我没有写明是什么原子的POSCAR VMD竟然自己帮我识别出来是H和C了!!
这又是个什么情况呐?
7楼2012-05-11 15:39:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuzhaonan

铁杆木虫 (著名写手)

第一性原理计算大师


fzx2008: 金币+1, 正解! 2012-05-15 20:16:03
引用回帖:
7楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-05-11 15:39:46:
按你这么说 我试了一下自己平时写的POSCAR
我的POSCAR都是按照第一种那样写的
没有表明是什么元素 按照这个说法 我用VMD打开这个POSCAR时
不是应该显示不出我打开的这个结构上分别是什么原子吗?
不是按理来 ...

应该是从赝势中读取了
玩第一性原理就如看大片
8楼2012-05-13 14:39:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiongb123456

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by chuzhaonan at 2012-05-13 14:39:15:
应该是从赝势中读取了

我用VMD打开的是POSCAR哟
为什么会有赝势呐?
9楼2012-05-15 17:12:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuzhaonan

铁杆木虫 (著名写手)

第一性原理计算大师

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fzx2008: 金币+1, 谢谢指教 2012-05-15 20:16:12
引用回帖:
9楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-05-15 17:12:44:
我用VMD打开的是POSCAR哟
为什么会有赝势呐?

我用其他软件打开时,会顺便读取与POSCAR同文件下的赝势文件,标出元素符号。不知道你是否属于这种

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

玩第一性原理就如看大片
10楼2012-05-15 18:23:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 egogg 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 收08调剂生 +6 komorebi69 2026-03-18 6/300 2026-03-24 19:09 by 汪!?!
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 一志愿武理材料工程348求调剂 +6  ̄^ ̄゜汗 2026-03-19 9/450 2026-03-23 19:53 by pswait
[考研] 一志愿陕师大生物学071000,298分,求调剂 +3 SYA! 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:09 by macy2011
[考研] 316求调剂 +7 梁茜雯 2026-03-19 7/350 2026-03-23 16:21 by lingjue
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +11 枫桥ZL 2026-03-18 13/650 2026-03-22 20:26 by edmund7
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:12 by 朱芷琳
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 280求调剂 +11 咕噜晓晓 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:40 by ACS Nano——
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 .m.. 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:25 by barlinike
[考研] 0805材料320求调剂 +3 深海物语 2026-03-20 3/150 2026-03-21 15:46 by 无际的草原
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
信息提示
请填处理意见