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egogg

木虫 (小有名气)

[交流] POSCAR的格式问题(vasp4与vasp5) 已有4人参与

看vasp官方文档上面POSCAR的格式是这样的:
1: Title                                         POSCAR
2: Scale                                       1.0
3: Vector_a                                 5.0  0.0  0.0
4: Vector_b                                 0.0  5.0  0.0
5: Vector_c                                 0.0  0.0  5.0
6: atom numbers                        4  5
7: Selective Dynamics                 Selective Dynamics
8: Coordinate Format                 Direct
9: Coordinates                           0.0 0.0 0.0   F F T
...

现在我忽然看到这样一种格式:

1: Title                                         POSCAR
2: Scale                                       1.0
3: Vector_a                                 5.0  0.0  0.0
4: Vector_b                                 0.0  5.0  0.0
5: Vector_c                                 0.0  0.0  5.0
6: Ion types                                C  H  O  N
7: atom numbers                        4  5
8: Selective Dynamics                 Selective Dynamics
9: Coordinate Format                 Direct
10: Coordinates                          0.0 0.0 0.0   F F T
...

这两种格式都可以用么?是vasp4和vasp5的区别么?vasp5的格式更新在官方文档的什么地方可以查找到?谢谢!
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xiongb123456

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
其实下面的那一种的第六行算不算是多余的呐?
因为你不管POSCAR怎么写
POTCAR里的赝势也是与前面的原子一类一类对应地
我可以这样理解吗?
2楼2012-05-11 15:08:03
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egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-05-11 15:08:03:
其实下面的那一种的第六行算不算是多余的呐?
因为你不管POSCAR怎么写
POTCAR里的赝势也是与前面的原子一类一类对应地
我可以这样理解吗?

我看到一些三方软件例如VMD,VESTA等等生成或读取的POSCAR格式都是下面的那一种,就是说它们都能解析第6行的离子类型。

就是不知道运算的时候能不能用下面的那一种,我自己一直是按照vasp手册上的方式把下面的那一种改成上面的。不知道有没有人用过下面的那一种格式。
3楼2012-05-11 15:15:21
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-05-15 20:15:20
这是vasp5.x和以前版本的区别,
不过对于以前的格式5.x兼容,
也就是说只要是用5.x的版本的两种格式都可以正常使用
4楼2012-05-11 15:17:51
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egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-05-11 15:17:51:
这是vasp5.x和以前版本的区别,
不过对于以前的格式5.x兼容,
也就是说只要是用5.x的版本的两种格式都可以正常使用

谢谢回复,确认这两种格式都能用么?不知道哪儿有官方的文档?
5楼2012-05-11 15:21:03
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by egogg at 2012-05-11 15:21:03:
谢谢回复,确认这两种格式都能用么?不知道哪儿有官方的文档?

用个例子试一下就可以了啊,没那么复杂啊,呵呵
6楼2012-05-11 15:33:29
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xiongb123456

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by egogg at 2012-05-11 15:15:21:
我看到一些三方软件例如VMD,VESTA等等生成或读取的POSCAR格式都是下面的那一种,就是说它们都能解析第6行的离子类型。

就是不知道运算的时候能不能用下面的那一种,我自己一直是按照vasp手册上的方式把下面的 ...

按你这么说 我试了一下自己平时写的POSCAR
我的POSCAR都是按照第一种那样写的
没有表明是什么元素 按照这个说法 我用VMD打开这个POSCAR时
不是应该显示不出我打开的这个结构上分别是什么原子吗?
不是按理来说应该是全部一样的原子吗?只是结构摆在那里而已

可是 奇怪的事情是 我没有写明是什么原子的POSCAR VMD竟然自己帮我识别出来是H和C了!!
这又是个什么情况呐?
7楼2012-05-11 15:39:46
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chuzhaonan

铁杆木虫 (著名写手)

第一性原理计算大师


fzx2008: 金币+1, 正解! 2012-05-15 20:16:03
引用回帖:
7楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-05-11 15:39:46:
按你这么说 我试了一下自己平时写的POSCAR
我的POSCAR都是按照第一种那样写的
没有表明是什么元素 按照这个说法 我用VMD打开这个POSCAR时
不是应该显示不出我打开的这个结构上分别是什么原子吗?
不是按理来 ...

应该是从赝势中读取了
玩第一性原理就如看大片
8楼2012-05-13 14:39:15
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xiongb123456

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by chuzhaonan at 2012-05-13 14:39:15:
应该是从赝势中读取了

我用VMD打开的是POSCAR哟
为什么会有赝势呐?
9楼2012-05-15 17:12:44
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chuzhaonan

铁杆木虫 (著名写手)

第一性原理计算大师

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fzx2008: 金币+1, 谢谢指教 2012-05-15 20:16:12
引用回帖:
9楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-05-15 17:12:44:
我用VMD打开的是POSCAR哟
为什么会有赝势呐?

我用其他软件打开时,会顺便读取与POSCAR同文件下的赝势文件,标出元素符号。不知道你是否属于这种

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玩第一性原理就如看大片
10楼2012-05-15 18:23:56
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