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聚合物的模型,退火和NPT,NVT要做到什么程度就能保证结构合理?
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zyj8119
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聚合物的模型,退火和NPT,NVT要做到什么程度就能保证结构合理?
聚合物也可以吸附小分子气体,但是看了很多文献,不知道聚合物的结构在很多次退火,NVT,NPT后,怎么样才算合理?
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1楼
2012-05-05 01:43:31
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聚合物建立盒子后进行NVT,NPT计算后,能量没怎么变化……
想问问楼主是不是相关参数设置有问题呢?
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我的眼里只有苯环
5楼
2012-07-27 09:51:34
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ChemiAndy
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2012-05-05 15:14:46
如果你对"合理"的定义是跟真实结构一致的话,那基本上没人能回答你。
如果说合理只是当前模型以及约束下的采样,则体系只要是已经平衡,则所采构型皆算合理,而且时间越长,平均结果越合理。
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2楼
2012-05-05 14:30:47
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zyj8119
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2楼
:
Originally posted by
ChemiAndy
at 2012-05-05 14:30:47:
如果你对"合理"的定义是跟真实结构一致的话,那基本上没人能回答你。
如果说合理只是当前模型以及约束下的采样,则体系只要是已经平衡,则所采构型皆算合理,而且时间越长,平均结果越合理。
但是不可能无限的让其平衡撒,时间上耗不起,我看到文献上说,只要聚合物的比表面与实验差不多就算其合理了。
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3楼
2012-05-05 14:46:34
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ChemiAndy
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zh1987hs: 金币+3, 谢谢
2012-05-07 08:21:09
哦。你说的应该是比表面性质“收敛”。
是的,不同的性质其收敛时间不同,模拟多长时间取决于你感兴趣的性质。不过,“跟实验产不多”恐怕很难,毕竟所用的力场模型都是有误差的。要收敛则简单, Plot一下比表面随时间的变化,成平坦直线即可。
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4楼
2012-05-07 03:08:54
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