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金虫 (正式写手)

一段遗失的美好

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[求助] 有关PDB数据库的使用问题

最近做一个关于蛋白质3D结构相关的实验，涉及到蛋白质的空间构象，以及蛋白质在实验过程中的相关变化，所以要用到PDB数据库里面的蛋白质的空间结构。有做相关的大侠，可进来交流一下。
1.首先，我想问问，我只是知道蛋白质的名称，不知道蛋白质的检索ID怎么去检索其相应的3D结构？
2.PDB数据库有木有收录同种蛋白质的不同的聚体形式，比喻单体和二聚体的3D结构？如果有这样的，；请问你怎么检索？
3.能检索到相关3D结构的是蛋白是不是都是改蛋白在结晶状态下的3D结构？

期待和给位大侠们交流！

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1楼2012-05-04 17:07:18

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引用回帖:

5楼: Originally posted by 98765432112 at 2012-05-04 22:17:59:
进入PDB数据库网页：http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do 输入蛋白质名称，对于一种蛋白可能有很多种晶体结构，收录到PDB数据库，这个你可以根据它们的描述去选择你需要的晶体图，下载它们PDB格式的图即可，这些 ...

这个软件我已近装了，还有我想问问，同种蛋白质的不同聚合度的能在PDB数据库中个找到么？