24小时热门版块排行榜    

查看: 5926  |  回复: 14
本帖产生 2 个 1ST强帖 ,点击这里进行查看

egogg

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢指教 2012-05-04 15:50:29
可以用vmd。
vmd导入outcar之后,选定你所需要的帧,右键保存坐标就能把相应的结构数据导出来。
11楼2012-05-04 13:25:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mika

金虫 (正式写手)

纳米宝贝

引用回帖:
11楼: Originally posted by egogg at 2012-05-04 13:25:06:
可以用vmd。
vmd导入outcar之后,选定你所需要的帧,右键保存坐标就能把相应的结构数据导出来。

谢谢,怎么给你发金币呢~
12楼2012-05-04 16:32:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
其实算出来有个文件叫XDATCAR,就是楼主要的东西。
13楼2012-05-04 17:55:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

showtime0703

新虫 (初入文坛)

怎么样根据OUTCAR中的坐标在MS中建立模型呢
14楼2014-07-13 00:01:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

呦咯啊

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dxf_dxf_dxf at 2012-05-03 13:26:11
由此给出思路及相应脚本:
  首先,要知道体系有多少个原子。这个可以从POSCAR中读取。
  然后,要告诉脚本,你关心的是哪个原子。我们把这个原子在POSCAR中的序号写到一个叫“in”的文件里面,让脚本去读就好了! ...

请问我们只需要找到行数对体系原子数取余数后结果为我们关心的原子对应的序数的行就行了:
NR%2==0(第2个原子,也就是余数为2,即余数为0)
能解释的详细一些吗? 比如我相输出的原胞为16个原子的,原子个数为 A=8 B=4 C=4  那么我想要B原子的坐标, 请问我应该怎么输呀   


本人没有语句功底   希望能得到解答  谢谢
15楼2015-10-28 17:28:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 mika 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 20:36 by xxniao123
[基金申请] 青基如何破局 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见