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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 计算neb出错，请高手帮忙看看
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jixiao0526

金虫 (小有名气)

[求助] 计算neb出错，请高手帮忙看看

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1楼2012-05-01 16:29:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

likai0106

金虫 (小有名气)
★
WDD880227: 金币+1, 感谢您的耐心指导 2012-05-03 08:27:49
引用回帖:
19楼: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-02 21:20:12:
running on    4 nodes
each image running on    1 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    1 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found type information on POSCAR  CI fi
01/POSCAR fo ...

楼主检查一下node7有没有问题，看看node7上mpi好用么？确定node7上没有问题再交。
赞一下 回复此楼
20楼2012-05-03 07:29:18
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 28 个回答

jixiao0526

金虫 (小有名气)
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/mpich2-1.3.1/bin/mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $np  /home/dftsoft/vasp_build/vasp.5.2/vasp_gobals_ifort
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2楼2012-05-01 16:36:38
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+2, 感谢您的细心解答 2012-05-02 18:39:01
引用回帖:
2楼: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-01 16:36:38:
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/ ...

两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值
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3楼2012-05-02 09:40:32
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by likai0106 at 2012-05-02 09:40:32:
两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值

两个问题都不是…
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4楼2012-05-02 10:25:45
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
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