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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 计算neb出错，请高手帮忙看看
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jixiao0526

金虫 (小有名气)

[求助] 计算neb出错，请高手帮忙看看

Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
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1楼2012-05-01 16:29:30
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by gfei2008 at 2012-05-02 20:37:00:
你的INCAR好像设置有问题要加上要是你已经把相关部分编译进去的话，在INCAR中在设置：
ICHAIN=0

running on    4 nodes
each image running on    1 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    1 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found type information on POSCAR  CI fi
01/POSCAR found :  2 types and   95 ions
WARNING: type information on POSCAR and POTCAR are incompatible
POTCAR overwrites the type information in POSCAR
typ   1 type information:  CI Mo
WARNING: type information on POSCAR and POTCAR are incompatible
POTCAR overwrites the type information in POSCAR
typ   2 type information:  fi O
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR found type information on POSCAR  CI fi
00/POSCAR found :  2 types and   95 ions
POSCAR found type information on POSCAR  CI fi
05/POSCAR found :  2 types and   95 ions

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      The distance between some ions is very small                           |
|      please check the nearest neigbor list in the OUTCAR file               |
|          I HOPE YOU KNOW, WHAT YOU ARE  DOING                               |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...(          16 )
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
rank 0 in job 1  node7_37523   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: killed by signal 9
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19楼2012-05-02 21:20:12
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查看全部 28 个回答

jixiao0526

金虫 (小有名气)
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/mpich2-1.3.1/bin/mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $np  /home/dftsoft/vasp_build/vasp.5.2/vasp_gobals_ifort
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2楼2012-05-01 16:36:38
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+2, 感谢您的细心解答 2012-05-02 18:39:01
引用回帖:
2楼: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-01 16:36:38:
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/ ...

两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值
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3楼2012-05-02 09:40:32
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by likai0106 at 2012-05-02 09:40:32:
两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值

两个问题都不是…
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4楼2012-05-02 10:25:45
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