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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 计算neb出错，请高手帮忙看看
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jixiao0526

金虫 (小有名气)

[求助] 计算neb出错，请高手帮忙看看

Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
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1楼 2012-05-01 16:29:30
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
???????:
16?: Originally posted by gfei2008 at 2012-05-02 20:37:00:
???INCAR???????????????????????????????????????????????INCAR?????????
ICHAIN=0

帮我看看这是什么问题
running on    4 nodes
each image running on    1 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    1 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found type information on POSCAR  CI fi
01/POSCAR found :  2 types and   95 ions
WARNING: type information on POSCAR and POTCAR are incompatible
POTCAR overwrites the type information in POSCAR
typ   1 type information:  CI Mo
WARNING: type information on POSCAR and POTCAR are incompatible
POTCAR overwrites the type information in POSCAR
typ   2 type information:  fi O
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR found type information on POSCAR  CI fi
00/POSCAR found :  2 types and   95 ions
POSCAR found type information on POSCAR  CI fi
05/POSCAR found :  2 types and   95 ions

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      The distance between some ions is very small                           |
|      please check the nearest neigbor list in the OUTCAR file               |
|          I HOPE YOU KNOW, WHAT YOU ARE  DOING                               |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...(          16 )
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
rank 0 in job 1  node7_37523   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: killed by signal 9
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18楼2012-05-02 21:20:05
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查看全部 28 个回答

jixiao0526

金虫 (小有名气)
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/mpich2-1.3.1/bin/mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $np  /home/dftsoft/vasp_build/vasp.5.2/vasp_gobals_ifort
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2楼2012-05-01 16:36:38
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+2, 感谢您的细心解答 2012-05-02 18:39:01
引用回帖:
2楼: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-01 16:36:38:
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/ ...

两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值
赞一下 回复此楼
3楼2012-05-02 09:40:32
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by likai0106 at 2012-05-02 09:40:32:
两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值

两个问题都不是…
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4楼2012-05-02 10:25:45
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