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残暴的肉球

(文坛精英)

小弟一枚

[求助] 请问什么软件可以模拟出电子云密度等，最好还能告知教程在何处

本人大四学生一名，所以对于这方面的软件知之甚少。只会用Chenm3D，电脑最近也装了高斯，但是不会。

最近需要计算一下取代苯上各个出电子云的密度（或者说是相对含量）。我在一本书上看到它提了这么一句，说它给出的数据是计算出来的，而不是测量出来的。所以我希望各位大虾能告诉我那款软件比较合适？能提供教程最好。

而且本人比较贪心，希望软件最好能模拟出更过的物理量，甚至是过渡态的能量也能模拟。当然也不强求，我现在需要的就是电子云密度。而且是有数值的，我查到的高斯是用图形来定性说明的，没有找到定量的方法。

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1楼 2012-04-29 10:11:50
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回帖置顶 ( 共有2个 )

caijj09

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, thank you 2012-04-29 15:05:14
残暴的肉球: 回帖置顶 2012-04-29 21:48:22
残暴的肉球: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢你，虽然这款软件我还不会用，但是我近期就会钻研的，遇到不会的地方也许还要麻烦你呢 2012-04-29 21:49:20
MS可以啊。你用MS的CASTEP模块就行。利用CASTEP可以计算电子云密度，声子谱等，利用MS中的LST/QST可以模拟过渡态。
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自强不息
2楼2012-04-29 14:43:47
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残暴的肉球

(文坛精英)

小弟一枚
残暴的肉球: 回帖置顶 2012-04-29 18:32:20
还有最好能模拟出空腔的大小呢，比如环糊精、冠醚等物质的。
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7楼2012-04-29 18:32:16
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普通回帖

caijj09

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs: 金币+2, thank you 2012-04-29 15:05:21
对了，LST/QST在MS上的 Dmol3模块中，貌似其他模块也可以实现。我只做分子吸附模拟，对这一块不是很熟悉
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自强不息
3楼2012-04-29 14:44:55
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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, thank you 2012-04-30 09:30:35
castep是可以，但貌似不能做非周期性结构。还是用gaussian吧
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喂人民服雾。
4楼2012-04-29 16:02:41
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残暴的肉球

(文坛精英)

小弟一枚
引用回帖:
2楼: Originally posted by caijj09 at 2012-04-29 14:43:47:
MS可以啊。你用MS的CASTEP模块就行。利用CASTEP可以计算电子云密度，声子谱等，利用MS中的LST/QST可以模拟过渡态。

那是否可以模拟出空腔的大小呢，比如环糊精、冠醚等物质的。
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5楼2012-04-29 18:31:39
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残暴的肉球

(文坛精英)

小弟一枚
引用回帖:
4楼: Originally posted by 书万里 at 2012-04-29 16:02:41:
castep是可以，但貌似不能做非周期性结构。还是用gaussian吧

那是否可以模拟出空腔的大小呢，比如环糊精、冠醚等物质的。
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6楼2012-04-29 18:31:48
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caijj09

木虫 (职业作家)
★
zh1987hs: 金币+1, thank you 2012-04-30 09:30:45
引用回帖:
4楼: Originally posted by 书万里 at 2012-04-29 16:02:41:
castep是可以，但貌似不能做非周期性结构。还是用gaussian吧

可以建个盒子，一样用
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自强不息
8楼2012-04-29 21:14:49
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caijj09

木虫 (职业作家)
★
zh1987hs: 金币+1, thank you 2012-04-30 09:30:50
引用回帖:
5楼: Originally posted by 残暴的肉球 at 2012-04-29 18:31:39:
那是否可以模拟出空腔的大小呢，比如环糊精、冠醚等物质的。

这个在MS里有相应的模块，比如Amorphorous Cell
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自强不息
9楼2012-04-29 21:15:22
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caijj09

木虫 (职业作家)
★
zh1987hs: 金币+1, thank you 2012-04-30 09:31:00
引用回帖:
6楼: Originally posted by 残暴的肉球 at 2012-04-29 18:31:48:
那是否可以模拟出空腔的大小呢，比如环糊精、冠醚等物质的。

貌似做生物大分子的，用Discover比较多
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自强不息
10楼2012-04-29 21:15:50
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