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MS中各基组的含义
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大家好。我在学习MS。先用dmol3计算了H2O分子的算例：DNP基组。我对于基组的设置不太明白，读不懂.outmol中的关于基组的部分 “Hydrogen nbas= 1, z= 1, nrfn= 3, rcut= 6.99, e_ref= -0.043138 Ha rcore= 0.00 zval= 1.00 1.00 n主量子数 L 轨道量子数 occ：占据程度 e：此轨道的本证能量 n=1 L=0 occ= 1.00 e= -0.232994Ha -6.3401eV n=1 L=0 occ= 0.00 e= -0.844913Ha -22.9913eV n=2 L=1 occ= 0.00 e= -1.999991Ha -54.4226eV Oxygen nbas= 2, z= 8, nrfn= 7, rcut= 6.99, e_ref= -0.057357 Ha rcore= 0.00 zval= 8.00 8.00 n=1 L=0 occ= 2.00 e= -18.907598Ha -514.5021eV n=2 L=0 occ= 2.00 e= -0.876373Ha -23.8473eV n=2 L=1 occ= 4.00 e= -0.330740Ha -8.9999eV n=2 L=0 occ= 0.00 e= -2.144799Ha -58.3630eV n=2 L=1 occ= 0.00 e= -1.593898Ha -43.3722eV n=3 L=2 occ= 0.00 e= -2.722210Ha -74.0751eV n=3 L=2 occ= 0.00 e= -1.387900Ha -37.7667eV eliminated ” 我想问下，nbas(？) e_ref(the calculated atomic reference energy)具体是什么意思，如何得到的？nrfn好像是给定原子的基函数的数目。本例中O的第七个函数怎么是eliminated？帮助文件中好像说： “The atomic program generates all atomic numeric basis sets, typically with several polarization functions. These functions can be used in a DMol3 calculation by using the extended or all keyword. You can select specific orbitals to be used in the calculation by using the user keyword.” 所以，程序一开始就产生所有的原子基组，包括极化函数；然后，使用时，根据DNP DN DND等类型的指定，确定哪些基组是有用的 或 eliminated？ Minimal、DNP、DN、DND基组具体如何理解？ 我查了下资料： MIN (Minimal) 极小基组，对每一个占据分子轨道用自由原子的一个原子轨道展开； DN (Double Numeric) 双数字基组，对每一个占据分子轨道近似地用自由原子的两个原子轨道展开。我看到MS帮助文件中对O元素采用DN基组后， “Oxygen nbas= 2, z= 8, nrfn= 7, rcut= 6.24, e_ref= -0.054 Ha rcore= 0.00 zval= 8.00 8.00 n=1 L=0 occ= 2.00 e= -18.758046Ha -510.4326eV n=2 L=0 occ= 2.00 e= -0.871142Ha -23.7050eV n=2 L=1 occ= 4.00 e= -0.338180Ha -9.2023eV n=2 L=0 occ= 0.00 e= -2.130079Ha -57.9624eV n=2 L=1 occ= 0.00 e= -1.593478Ha -43.3608eV n=3 L=2 occ= 0.00 e= -2.722222Ha -74.0755eV eliminated n=3 L=2 occ= 0.00 e= -1.388886Ha -37.7935eV eliminated” 那么，自由原子的两个原子轨道好像是第二组价电子原子轨道出现两次吗。一个轨道怎么会出现两次，且有不同的本证能量？ DNP (Double Numeric with Polarization) 增加了极化函数的双数值基组（极化函数：函数中存在高于自由原子中的最高占据轨道角动量的角动量）；这里极化函数，我不太明白。假如某原子最高占据轨道为1s，那么极化函数为2p,还是1p？某原子最高占据轨道为2s，那么极化函数为2p，还是3p？某原子最高占据轨道为2p，那么极化函数为2d，还是3d？某原子最高占据轨道为3d，那么极化函数为多少？最高占据轨道4f,极化函数是多少？ DND Double Numerical plus d-functions。除了对氢原子不使用 p轨道函数外，与 DNP基组相同？；又或者，DNP基组是在DND基组上在所有氢原子上附加了极化p函数。DND是对所有非氢原子加了d函数，那么，DNP中所有非氢原子的极化函数都是(主量子数+1)的d轨道吗？  [ Last edited by Yolanda7 on 2012-4-28 at 09:41 ] |
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看了下扬州大学MS售后培训，对基组稍微理解： • Min：一个占位原子轨道只使用一个数值轨道基组。速度更快，精度最低。 • DN：双数值轨道基组。在Min基组的基础上加入了第二组价电子原子轨道。 • DND：双数值轨道基组+d轨道极化函数。与DN基组类似，但是为所有非氢原子加入了d轨道函数极化。为DMol3模块默认基组，在可接受的计算时内，确保精度在可接受的范围内。也是DMol3计算的最低可信精度基组。 • DNP：双数值轨道基组+p轨道极化函数。与DND基组类似，但是为所有氢原子加入了p轨道函数极化。 精度更高，计算时间更长。对于氢键计算更为重要。 • TNP：三数值轨道基组+轨道极化函数。 与DNP基组类似，为所有原子加入极化函数。目前只能够使用与H到Cl的元素，且不包括He和Ne。 精度更高，计算时间更长。 |
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