24小时热门版块排行榜    

查看: 1027  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

baihe869

金虫 (小有名气)

[求助] Linux远程操作chk文件无法转换

我最近用SSH远程操作,在集群上用Gaussian 09计算得到的chk文件,在转换成fchk文件时总出错。
注:计算是正常结束的,重新算了还是这样,现在已经证实chk文件没有问题。请各位帮我分析一下到底是什么原因?
我在windows下远程操作linux系统输入的命令是:formchk *.chk
然后就出现了一下编码:
smj@gomberg00:~$ formchk HBC.chk
Read checkpoint file HBC.chk
Write formatted file HBC.fchk
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len=       44100 IPos=           0 Q=         13504352


dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =    47 SizExt =     32768 WInBlk =       512
                   defal = F LstWrd =     2490368 FType=2 FMxFil=10000

Number           0          0          0          0          0          0          0          0
Base       1226088    2270286     237438    1325575    1244530     568981    1891640    2384653
End        1226090    2286749     243230    1455904    1324053     826632    2092796    2490368
End1       1226090    2286749     243230    1455904    1324053     826632    2092796    2490368
Wr Pntr    1226088    2270286     237438    1325575    1244530     568981    1891640    2384653
Rd Pntr    1226088    2270286     237438    1325575    1244530     568981    1891640    2384653
Length           2      16463       5792     130329      79523     257651     201156     105715

Number         501        502        503        508        511        520        521        522
Base        439036     440036    1324794      40960     448542     568905     826632      41190
End         440036     444804    1325215      40990     534864     568915     826667      42074
End1        440036     444804    1325215      40990     534864     568915     826667      42074
Wr Pntr     439036     440036    1324794      40960     448542     568905     826632      41190
Rd Pntr     439036     440036    1324794      40960     448542     568905     826632      41190
Length        1000       4768        421         30      86322         10         35        884

Number         524        526        536        538        545        548        551        552
Base        826667    1022031     243230     341133    1242443      42074     568943     568915
End        1022031    1217395     341133     439036    1242471     237438     568981     568943
End1       1022031    1217395     341133     439036    1242471     237438     568981     568943
Wr Pntr     826667    1022031     243230     341133    1242443      42074     568943     568915
Rd Pntr     826667    1022031     243230     341133    1242443      42074     568943     568915
Length      195364     195364      97903      97903         28     195364         38         28

Number         561        562        569        575        584        585        603        605
Base        562196     562197    1242441    2092796     538594    1226151    2286749    1226090
End         562197     568905    1242443    2270286     538954    1242441    2384653    1226151
End1        562197     568905    1242443    2270286     538954    1242441    2384653    1226151
Wr Pntr     562196     562197    1242441    2092796     538594    1226151    2286749    1226090
Rd Pntr     562196     562197    1242441    2092796     538594    1226151    2286749    1226090
Length           1       6708          2     177490        360      16290      97904         61

Number         607        619        665        670        672        674        694        695
Base       1243204    1217395     534864     444804    1324053    1324222    1243646     538954
End        1243646    1226088     538594     448542    1324222    1324794    1244530     540842
End1       1243646    1226088     538594     448542    1324222    1324794    1244530     540842
Wr Pntr    1243204    1217395     534864     444804    1324053    1324222    1243646     538954
Rd Pntr    1243204    1217395     534864     444804    1324053    1324222    1243646     538954
Length         442       8693       3730       3738        169        572        884       1888

Number         698        701        773        989        993        997        998
Base       1325215    1242471    1455904     540842     560842     561042      40990
End        1325575    1243204    1891640     560842     561042     562196      41190
End1       1325575    1243204    1891640     560842     561042     562196      41190
Wr Pntr    1325215    1242471    1455904     540842     560842     561042      40990
Rd Pntr    1325215    1242471    1455904     540842     560842     561042      41090
Length         360        733     435736      20000        200       1154        200
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
Segmentation fault
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2012-04-25 19:20:46
baihe869: 金币+5, ★★★很有帮助, thanks 2012-04-27 23:25:08
假如你的用户名为user,g09安装在user下,则
/home/user/g09/formchk  HBC.chk HBC.fch

如果仍不行,考虑加大内存
在环境变量中加入
export GAUSS_MEMDEF=2000000000(数字依情况而定)
再执行。
3楼2012-04-25 18:39:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

zhangji3013

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
小红豆: 编辑内容 2012-04-26 21:13
[ Last edited by 小红豆 on 2012-4-26 at 21:13 ]
2楼2012-04-25 17:19:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研孤儿太难了 +14 我4大白菜 2026-08-20 15/750 2026-08-20 22:33 by 袁向阳007
[基金申请] 言之凿凿,明天官网会通知放榜? +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 22/1100 2026-08-20 17:03 by yaoyewhu2008
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+3 snowwithsea 2026-08-19 12/600 2026-08-20 15:56 by lfy8008
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见