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刘雪鹏木虫 (小有名气)
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[求助]
在MS中如何将金晶体切割成近似球形体
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| 小弟做毕业设计，最近刚接触MS，想做两个金纳米粒子的自组装模拟，我是先从MS软件库中调出金晶体的面心立方体结构，然后想将它切割成近似球形结构（参考一篇文献讲的），但不知道怎么操作，望大家能够帮助 |
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 高分子学习--qlh | MS 吸附模拟 | MS 画图 |
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7楼2012-04-25 18:53:58
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3楼2012-04-25 10:00:22
【答案】应助回帖
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zh1987hs: 金币+10, 模拟EPI+1, 鼓励如此详细的应助！呵呵 2012-04-25 15:35:25
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MS 中我的不会，告诉你个曲线救国的办法——在VMD 中建立金颗粒的球形结构： 1、  打开VMD ，选择建模 2、  在task里面选择 build device，材料就选择金 根据你想要建立的金颗粒的大小，在box dimension 中选择盒子的长度，点击 add exclusion 3、  选择 VMD selection block name 不用管 include only “sqrt(x*x+y*y+z*z)<100” 这个是选择球状的表达式 100埃米是球半径，这个换成你需要的就行了。 别忘了点击add 最后点击图二中的 Build device OK, 球状金颗粒闪亮登场！  注意，我给你示意的这个数比较大，建模的时候很耗时间，你自己试试的时候，别选这么大。 VMD 输出的PDB文件可以导入到MS中，继续你熟悉的操作！ [ Last edited by jiaoyixiong on 2012-4-25 at 14:03 ] |
4楼2012-04-25 13:48:15