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lid5251

新虫 (小有名气)

[求助] TODOCK中torsion最大值常数怎么设置

Autodock运行失败,提示的原因是可扭曲的键书目太多,大于32,说是可以修改限定值32,提示如下:
#define MAX_TORS     32       /* Maximum number of torsions in Small Molecule. */
可是怎么也找不到上述的constants.h文件里面修改最大值的一行,有哪位高手懂啊?指指点一下,万分感谢!!
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lid5251

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2012-04-24 08:03:03:
你的小分子对接之前,经过能量优化了吗?然后在autodock里面经过加氢啊,计算电荷,合并非极性氢等操作了吗..........

操作了啊
3楼2012-04-24 08:39:10
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longdlut

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
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zh1987hs: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-24 08:26:03
lid5251: 金币+2 2012-04-24 08:39:26
你的小分子对接之前,经过能量优化了吗?然后在autodock里面经过加氢啊,计算电荷,合并非极性氢等操作了吗..........
2楼2012-04-24 08:03:03
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


那就修改一下旋转键把!我今天也碰到了这样的一个分子,旋转键达到了36个,果断修改了几个感觉不重要的旋转键,变成了26个,再次对接试试效果!
4楼2012-04-25 12:00:36
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lid5251

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by longdlut at 2012-04-25 12:00:36:
那就修改一下旋转键把!我今天也碰到了这样的一个分子,旋转键达到了36个,果断修改了几个感觉不重要的旋转键,变成了26个,再次对接试试效果!

嗯,我也是这么做的,可以运行了,不过怎么看这样操作是否合适呢?
5楼2012-04-25 19:41:09
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