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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » TODOCK中torsion最大值常数怎么设置
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lid5251

新虫 (小有名气)

[求助] TODOCK中torsion最大值常数怎么设置

Autodock运行失败，提示的原因是可扭曲的键书目太多，大于32，说是可以修改限定值32，提示如下：
#define MAX_TORS     32       /* Maximum number of torsions in Small Molecule. */
可是怎么也找不到上述的constants.h文件里面修改最大值的一行，有哪位高手懂啊?指指点一下，万分感谢！！
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1楼 2012-04-23 15:03:16
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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zh1987hs: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-24 08:26:03
lid5251: 金币+2 2012-04-24 08:39:26
你的小分子对接之前，经过能量优化了吗？然后在autodock里面经过加氢啊，计算电荷，合并非极性氢等操作了吗..........
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2楼2012-04-24 08:03:03
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lid5251

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2012-04-24 08:03:03:
你的小分子对接之前，经过能量优化了吗？然后在autodock里面经过加氢啊，计算电荷，合并非极性氢等操作了吗..........

操作了啊
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3楼2012-04-24 08:39:10
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
那就修改一下旋转键把！我今天也碰到了这样的一个分子，旋转键达到了36个，果断修改了几个感觉不重要的旋转键，变成了26个，再次对接试试效果！
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4楼2012-04-25 12:00:36
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lid5251

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by longdlut at 2012-04-25 12:00:36:
那就修改一下旋转键把！我今天也碰到了这样的一个分子，旋转键达到了36个，果断修改了几个感觉不重要的旋转键，变成了26个，再次对接试试效果！

嗯，我也是这么做的，可以运行了，不过怎么看这样操作是否合适呢？
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5楼2012-04-25 19:41:09
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