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fegg7502

荣誉版主 (知名作家)

无

优秀版主
引用回帖:
19楼: Originally posted by bjmaowei25 at 2012-04-27 11:32:53:
版主，问一下，为什么不插入奇数个image呢？
NEB 方法好像没有规定插入是偶数哦！

而且插入奇数个像，更好的能找到过渡太的位置！
望请点评！

这个我还不清楚呢，，不过我没有用过插入奇数个的，你试试呢，，
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心诚意正，方可始终；身无苦灭，永登光明。
21楼2012-04-27 14:00:48
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bjmaowei25

铜虫 (小有名气)
★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-27 18:53:26
引用回帖:
21楼: Originally posted by fegg7502 at 2012-04-27 14:00:48:
这个我还不清楚呢，，不过我没有用过插入奇数个的，你试试呢，，

如果是CNEB，奇数或偶数个image, 对鞍点的寻找问题不大，因为它们之间不是等距的。对于NEB， 因为他们是等距的，所以在找鞍点，奇数个像点，应该会好一些。
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追求真理
22楼2012-04-27 14:33:15
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fegg7502

荣誉版主 (知名作家)

无

优秀版主

【答案】应助回帖

★
xueht987: 金币+1, 鼓励交流！ 2012-07-06 10:15:58
引用回帖:
22楼: Originally posted by bjmaowei25 at 2012-04-27 14:33:15
如果是CNEB，奇数或偶数个image, 对鞍点的寻找问题不大，因为它们之间不是等距的。对于NEB， 因为他们是等距的，所以在找鞍点，奇数个像点，应该会好一些。...

不是的，根据计算机配置，一般是偶数个核并行，我没有见过奇数个的，对于NEB，肯定要偶数个的，VASP中的neb手册上写的不够全面，需要自己检测，
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心诚意正，方可始终；身无苦灭，永登光明。
23楼2012-06-25 08:46:27
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lbing9002

木虫 (正式写手)
xueht987: 应助指数-1 2012-07-06 10:17:25
引用回帖:
16楼: Originally posted by fegg7502 at 2012-04-25 22:13:31
看你的每个节点几个CPU？最好一个cpu算一个点吧，，我以前都这么做的。
一般来说3个点比较小，你看你从初始物到反应物原子移动的距离是多少？一般来说，你让主要移动的原子在相邻点的位移差应该是小于0.2埃，太大 ...

试问nebmake是什么？
image的个数包含初态和末态还是不包含呢？
比如两个端点之间插入4个点，那么image个数应该是4还是6？POSCAR为00 01 02 03 04 有05和06吗？
如此计算，在这些POSCAR之外还要有其他POSCAR吗？
谢谢！
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穷则独善其身，达则兼济天下。
24楼2012-07-05 16:51:10
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lbing9002

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
xueht987: 金币+1, 应助指数+1, 鼓励交流！ 2012-07-06 10:17:43
看了一通说明书，看明白了，提交计算的文件夹中包含INCAR POTCAR KPOINTS 和子文件夹00 01...XX，其中00 和XX是初末位置，是固定的，计算时不计算00和XX的位置，那么image=XX-1
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穷则独善其身，达则兼济天下。
25楼2012-07-05 17:06:12
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bjmaowei25

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
23楼: Originally posted by fegg7502 at 2012-06-25 08:46:27
不是的，根据计算机配置，一般是偶数个核并行，我没有见过奇数个的，对于NEB，肯定要偶数个的，VASP中的neb手册上写的不够全面，需要自己检测，...

话是没错，但是可以利用cpu 中的一部分，打个比方只用4个cpu中的3个，如果你在NEB方法中采用奇数个image， 测试某些氧化物比如Al2O3,  也是很准的。上面的方法，主要是因为资源的限制。淡然如果条件允许，当然是采用偶数个合理一些。
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追求真理
26楼2012-07-06 14:08:27
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fegg7502

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
26楼: Originally posted by bjmaowei25 at 2012-07-06 14:08:27
话是没错，但是可以利用cpu 中的一部分，打个比方只用4个cpu中的3个，如果你在NEB方法中采用奇数个image， 测试某些氧化物比如Al2O3,  也是很准的。上面的方法，主要是因为资源的限制。淡然如果条件允许，当然是采 ...

27楼2012-07-08 21:30:25
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lyxc43

金虫 (正式写手)
楼主问题解决了吗？我也是这个问题呢。。。
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做好自己就是了。
28楼2014-03-28 21:09:58
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