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fegg7502

荣誉版主 (知名作家)

优秀版主

引用回帖:
19楼: Originally posted by bjmaowei25 at 2012-04-27 11:32:53:
版主,问一下,为什么不插入奇数个image呢?
NEB 方法好像没有规定插入是偶数哦!

而且插入奇数个像,更好的能找到过渡太的位置!
望请点评!

这个我还不清楚呢,,不过我没有用过插入奇数个的,你试试呢,,
心诚意正,方可始终;身无苦灭,永登光明。
21楼2012-04-27 14:00:48
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bjmaowei25

铜虫 (小有名气)


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-27 18:53:26
引用回帖:
21楼: Originally posted by fegg7502 at 2012-04-27 14:00:48:
这个我还不清楚呢,,不过我没有用过插入奇数个的,你试试呢,,

如果是CNEB,奇数或偶数个image, 对鞍点的寻找问题不大,因为它们之间不是等距的。对于NEB, 因为他们是等距的,所以在找鞍点,奇数个像点,应该会好一些。
追求真理
22楼2012-04-27 14:33:15
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fegg7502

荣誉版主 (知名作家)

优秀版主

【答案】应助回帖


xueht987: 金币+1, 鼓励交流! 2012-07-06 10:15:58
引用回帖:
22楼: Originally posted by bjmaowei25 at 2012-04-27 14:33:15
如果是CNEB,奇数或偶数个image, 对鞍点的寻找问题不大,因为它们之间不是等距的。对于NEB, 因为他们是等距的,所以在找鞍点,奇数个像点,应该会好一些。...

不是的,根据计算机配置,一般是偶数个核并行,我没有见过奇数个的,对于NEB,肯定要偶数个的,VASP中的neb手册上写的不够全面,需要自己检测,
心诚意正,方可始终;身无苦灭,永登光明。
23楼2012-06-25 08:46:27
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lbing9002

木虫 (正式写手)

xueht987: 应助指数-1 2012-07-06 10:17:25
引用回帖:
16楼: Originally posted by fegg7502 at 2012-04-25 22:13:31
看你的每个节点几个CPU?最好一个cpu算一个点吧,,我以前都这么做的。
一般来说3个点比较小,你看你从初始物到反应物原子移动的距离是多少?一般来说,你让主要移动的原子在相邻点的位移差应该是小于0.2埃,太大 ...

试问nebmake是什么?
image的个数包含初态和末态还是不包含呢?
比如两个端点之间插入4个点,那么image个数应该是4还是6?POSCAR为00 01 02 03 04 有05和06吗?
如此计算,在这些POSCAR之外还要有其他POSCAR吗?
谢谢!
穷则独善其身,达则兼济天下。
24楼2012-07-05 16:51:10
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lbing9002

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


xueht987: 金币+1, 应助指数+1, 鼓励交流! 2012-07-06 10:17:43
看了一通说明书,看明白了,提交计算的文件夹中包含INCAR POTCAR KPOINTS 和子文件夹00 01...XX,其中00 和XX是初末位置,是固定的,计算时不计算00和XX的位置,那么image=XX-1
穷则独善其身,达则兼济天下。
25楼2012-07-05 17:06:12
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bjmaowei25

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
23楼: Originally posted by fegg7502 at 2012-06-25 08:46:27
不是的,根据计算机配置,一般是偶数个核并行,我没有见过奇数个的,对于NEB,肯定要偶数个的,VASP中的neb手册上写的不够全面,需要自己检测,...

话是没错,但是可以利用cpu 中的一部分,打个比方只用4个cpu中的3个,如果你在NEB方法中采用奇数个image, 测试某些氧化物比如Al2O3,  也是很准的。上面的方法,主要是因为资源的限制。淡然如果条件允许,当然是采用偶数个合理一些。
追求真理
26楼2012-07-06 14:08:27
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fegg7502

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
26楼: Originally posted by bjmaowei25 at 2012-07-06 14:08:27
话是没错,但是可以利用cpu 中的一部分,打个比方只用4个cpu中的3个,如果你在NEB方法中采用奇数个image, 测试某些氧化物比如Al2O3,  也是很准的。上面的方法,主要是因为资源的限制。淡然如果条件允许,当然是采 ...

27楼2012-07-08 21:30:25
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lyxc43

金虫 (正式写手)

楼主问题解决了吗?我也是这个问题呢。。。
做好自己就是了。
28楼2014-03-28 21:09:58
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