24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3872  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

showcat

金虫 (小有名气)


[交流] gaussian 生成cosmo文件

我在用高斯计算cosmo文件时,看到很多程序都是分三个步骤:1,构型优化;2,PCM计算(radii=klamt);3,生成cosmo文件。我想单纯为了计算cosmo文件的话应该只有第1、3步就好了,为什么非要在生成cosmo之前进行溶剂化计算呢?我猜是不是用溶剂化之后的分子构型生成cosmo文件?所以就在两种情况下分别计算了CO2的cosmo文件,.gjf文件如下:
三步的:%chk=co2.chk
%mem=640mw
%nproc=8
#p b3lyp/6-31g* opt

cosmo

0  1
C 0    0.000000    0.015446    0.000000
O 0    0.000000   -1.237849    0.000000
O 0    0.000000    1.226261    0.000000

--Link1--
%chk=co2.chk
%mem=640MW
%nproc=8
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=(CPCM,Read) guess=read geom=checkpoint opt=(MAXCYCLE=99)

BP86/TZVP CPCM OPTIMlZATlON WlTH COSMO-RADII

0 1

RADII=KLAMT

--Link1--
%chk=co2.chk
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=COSMORS guess=read geom=checkpoint

BP86/TZVP COSMO SINGLE POINT

0 1

co2.cosmo
两步的:%chk=co2.chk
%mem=64mw
%nproc=1
#p b3lyp/6-31g* opt

cosmo

  0  1
C 0    0.000000    0.015446    0.000000
O 0    0.000000   -1.237849    0.000000
O 0    0.000000    1.226261    0.000000

--Link1--
%chk=co2.chk
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=COSMORS guess=read geom=checkpoint

BP86/TZVP COSMO SINGLE POINT

0 1

co2.cosmo
从两者的.out文件中我注意到,第一种情况下CO2键长第一步从1.2533优化到1.1692,第二步从1.1692收敛为1.1721(klamt半径),第三步计算cosmo文件时键长仍然为1.1692;第二种情况下CO2键长第一步从1.2533优化到1.1692,第二步计算cosmo文件时键长为1.1692。也就是说,在生成COSMO文件的时候,利用的分子构型是第一步优化后的构型,与第二步溶剂化无关!?
   
    各路大神,是我想多了,没有弄清计算cosmo文件的过程?还是说单纯计算cosmo文件时确实不需要进行溶剂化计算?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

孙玉洁

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 胡延杰 at 2017-07-07 17:10:24
你好!请问一下解决了吗?

你好,你在计算COSMO文件时 又遇到错误日志没有计算出来COSMO的情况吗?
6楼2018-07-14 11:23:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

showcat

金虫 (小有名气)


不要沉啊!各路大神,鼓励一下初学者吧!
2楼2012-04-18 19:48:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胡延杰

铁虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好!请问一下解决了吗?
3楼2017-07-07 17:10:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

孙玉洁

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
老哥,计算cosmo文件遇到错误,怎么办呢
4楼2018-07-02 17:16:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂 +7 嗯滴的基本都 2026-03-27 7/350 2026-03-28 04:19 by fmesaito
[考研] 学硕274求调剂 +5 Li李鱼 2026-03-26 5/250 2026-03-27 20:51 by 热情沙漠
[考研] 化学调剂 +4 爱吃番茄的旭 2026-03-24 5/250 2026-03-27 17:50 by kiokin
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 化学308分求调剂 +8 你好明天你好 2026-03-23 9/450 2026-03-27 14:01 by 杨光于青云
[考研] 一志愿吉大071010,316分求调剂 +3 xgbiknn 2026-03-27 3/150 2026-03-27 10:36 by guoweigw
[考研] 316求调剂 +5 江辞666 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:08 by hypershenger
[硕博家园] 招收生物学/细胞生物学调剂 +3 IceGuo 2026-03-26 4/200 2026-03-27 05:35 by user003
[考研] 321求调剂 +6 wasdssaa 2026-03-26 6/300 2026-03-26 20:57 by sanrepian
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 生物学学硕,一志愿湖南大学,初试成绩338 +4 YYYYYNNNNN 2026-03-26 4/200 2026-03-26 19:00 by macy2011
[考研] 一志愿 南京邮电大学 288分 材料考研 求调剂 +3 jl0720 2026-03-26 3/150 2026-03-26 13:39 by zzll406
[考研] 一志愿哈工大,085400,320,求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 299求调剂 +4 15188958825 2026-03-25 4/200 2026-03-25 22:56 by 418490947
[考研] 296求调剂 +4 汪!?! 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪!?!
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 300分,材料,求调剂,英一数二 +5 超赞的 2026-03-24 5/250 2026-03-24 21:07 by 星空星月
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见