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gaussian 生成cosmo文件
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我在用高斯计算cosmo文件时，看到很多程序都是分三个步骤：1，构型优化；2，PCM计算（radii=klamt）；3，生成cosmo文件。我想单纯为了计算cosmo文件的话应该只有第1、3步就好了，为什么非要在生成cosmo之前进行溶剂化计算呢？我猜是不是用溶剂化之后的分子构型生成cosmo文件？所以就在两种情况下分别计算了CO2的cosmo文件，.gjf文件如下： 三步的：%chk=co2.chk %mem=640mw %nproc=8 #p b3lyp/6-31g* opt cosmo 0 1 C 0 0.000000 0.015446 0.000000 O 0 0.000000 -1.237849 0.000000 O 0 0.000000 1.226261 0.000000 --Link1-- %chk=co2.chk %mem=640MW %nproc=8 #P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=(CPCM,Read) guess=read geom=checkpoint opt=(MAXCYCLE=99) BP86/TZVP CPCM OPTIMlZATlON WlTH COSMO-RADII 0 1 RADII=KLAMT --Link1-- %chk=co2.chk #P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=COSMORS guess=read geom=checkpoint BP86/TZVP COSMO SINGLE POINT 0 1 co2.cosmo 两步的：%chk=co2.chk %mem=64mw %nproc=1 #p b3lyp/6-31g* opt cosmo 0 1 C 0 0.000000 0.015446 0.000000 O 0 0.000000 -1.237849 0.000000 O 0 0.000000 1.226261 0.000000 --Link1-- %chk=co2.chk #P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=COSMORS guess=read geom=checkpoint BP86/TZVP COSMO SINGLE POINT 0 1 co2.cosmo 从两者的.out文件中我注意到，第一种情况下CO2键长第一步从1.2533优化到1.1692，第二步从1.1692收敛为1.1721（klamt半径），第三步计算cosmo文件时键长仍然为1.1692；第二种情况下CO2键长第一步从1.2533优化到1.1692，第二步计算cosmo文件时键长为1.1692。也就是说，在生成COSMO文件的时候，利用的分子构型是第一步优化后的构型，与第二步溶剂化无关！？ 各路大神，是我想多了，没有弄清计算cosmo文件的过程？还是说单纯计算cosmo文件时确实不需要进行溶剂化计算？ |
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