24小时热门版块排行榜    

查看: 4206  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

showcat

金虫 (小有名气)


[交流] gaussian 生成cosmo文件

我在用高斯计算cosmo文件时,看到很多程序都是分三个步骤:1,构型优化;2,PCM计算(radii=klamt);3,生成cosmo文件。我想单纯为了计算cosmo文件的话应该只有第1、3步就好了,为什么非要在生成cosmo之前进行溶剂化计算呢?我猜是不是用溶剂化之后的分子构型生成cosmo文件?所以就在两种情况下分别计算了CO2的cosmo文件,.gjf文件如下:
三步的:%chk=co2.chk
%mem=640mw
%nproc=8
#p b3lyp/6-31g* opt

cosmo

0  1
C 0    0.000000    0.015446    0.000000
O 0    0.000000   -1.237849    0.000000
O 0    0.000000    1.226261    0.000000

--Link1--
%chk=co2.chk
%mem=640MW
%nproc=8
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=(CPCM,Read) guess=read geom=checkpoint opt=(MAXCYCLE=99)

BP86/TZVP CPCM OPTIMlZATlON WlTH COSMO-RADII

0 1

RADII=KLAMT

--Link1--
%chk=co2.chk
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=COSMORS guess=read geom=checkpoint

BP86/TZVP COSMO SINGLE POINT

0 1

co2.cosmo
两步的:%chk=co2.chk
%mem=64mw
%nproc=1
#p b3lyp/6-31g* opt

cosmo

  0  1
C 0    0.000000    0.015446    0.000000
O 0    0.000000   -1.237849    0.000000
O 0    0.000000    1.226261    0.000000

--Link1--
%chk=co2.chk
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=COSMORS guess=read geom=checkpoint

BP86/TZVP COSMO SINGLE POINT

0 1

co2.cosmo
从两者的.out文件中我注意到,第一种情况下CO2键长第一步从1.2533优化到1.1692,第二步从1.1692收敛为1.1721(klamt半径),第三步计算cosmo文件时键长仍然为1.1692;第二种情况下CO2键长第一步从1.2533优化到1.1692,第二步计算cosmo文件时键长为1.1692。也就是说,在生成COSMO文件的时候,利用的分子构型是第一步优化后的构型,与第二步溶剂化无关!?
   
    各路大神,是我想多了,没有弄清计算cosmo文件的过程?还是说单纯计算cosmo文件时确实不需要进行溶剂化计算?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

孙玉洁

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
老哥,计算cosmo文件遇到错误,怎么办呢
4楼2018-07-02 17:16:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

showcat

金虫 (小有名气)


不要沉啊!各路大神,鼓励一下初学者吧!
2楼2012-04-18 19:48:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胡延杰

铁虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好!请问一下解决了吗?
3楼2017-07-07 17:10:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

孙玉洁

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问你计算COSMO文件时,有遇到郭错误的,结果没cosmo文件得情况吗?
5楼2018-07-14 11:18:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +5 炎黄贵胄 2026-08-22 6/300 2026-08-24 06:34 by sincosx
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +11 kulium 2026-08-21 14/700 2026-08-24 02:12 by 流流伤
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见