应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » gaussian 生成cosmo文件
51/1返回列表
查看: 3738  |  回复: 5
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

showcat

金虫 (小有名气)

[交流] gaussian 生成cosmo文件

我在用高斯计算cosmo文件时，看到很多程序都是分三个步骤：1，构型优化；2，PCM计算（radii=klamt）；3，生成cosmo文件。我想单纯为了计算cosmo文件的话应该只有第1、3步就好了，为什么非要在生成cosmo之前进行溶剂化计算呢？我猜是不是用溶剂化之后的分子构型生成cosmo文件？所以就在两种情况下分别计算了CO2的cosmo文件，.gjf文件如下：
三步的：%chk=co2.chk
%mem=640mw
%nproc=8
#p b3lyp/6-31g* opt

cosmo

0  1
C 0    0.000000    0.015446    0.000000
O 0    0.000000   -1.237849    0.000000
O 0    0.000000    1.226261    0.000000

--Link1--
%chk=co2.chk
%mem=640MW
%nproc=8
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=(CPCM,Read) guess=read geom=checkpoint opt=(MAXCYCLE=99)

BP86/TZVP CPCM OPTIMlZATlON WlTH COSMO-RADII

0 1

RADII=KLAMT

--Link1--
%chk=co2.chk
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=COSMORS guess=read geom=checkpoint

BP86/TZVP COSMO SINGLE POINT

0 1

co2.cosmo
两步的：%chk=co2.chk
%mem=64mw
%nproc=1
#p b3lyp/6-31g* opt

cosmo

  0  1
C 0    0.000000    0.015446    0.000000
O 0    0.000000   -1.237849    0.000000
O 0    0.000000    1.226261    0.000000

--Link1--
%chk=co2.chk
#P BP86/TZVP scf=(tight,novaracc) SCRF=COSMORS guess=read geom=checkpoint

BP86/TZVP COSMO SINGLE POINT

0 1

co2.cosmo
从两者的.out文件中我注意到，第一种情况下CO2键长第一步从1.2533优化到1.1692，第二步从1.1692收敛为1.1721（klamt半径），第三步计算cosmo文件时键长仍然为1.1692；第二种情况下CO2键长第一步从1.2533优化到1.1692，第二步计算cosmo文件时键长为1.1692。也就是说，在生成COSMO文件的时候，利用的分子构型是第一步优化后的构型，与第二步溶剂化无关！？
   
    各路大神，是我想多了，没有弄清计算cosmo文件的过程？还是说单纯计算cosmo文件时确实不需要进行溶剂化计算？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼2012-04-18 19:22:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

孙玉洁

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
老哥，计算cosmo文件遇到错误，怎么办呢
赞一下 回复此楼
4楼2018-07-02 17:16:16
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

showcat

金虫 (小有名气)
不要沉啊！各路大神，鼓励一下初学者吧！
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-04-18 19:48:09
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胡延杰

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好！请问一下解决了吗？
赞一下 回复此楼
3楼2017-07-07 17:10:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

孙玉洁

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问你计算COSMO文件时，有遇到郭错误的，结果没cosmo文件得情况吗？
赞一下 回复此楼
5楼2018-07-14 11:18:41
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭