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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS分子模拟的截断半径该怎么设？
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xiuhui

木虫 (正式写手)

[求助] MS分子模拟的截断半径该怎么设？

对于周期性边界条件体系，盒子边长的一半大于截断半径，那就是说截断半径小点没有关系吗？
对于非周期性体系，比如有机分子，截断半径要设吗？
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1楼 2012-04-18 17:29:11
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-18 19:10:40
取截断半径的目的是为了减少计算量，截断半径以内的才计算。选取的太小了，计算会不准确。
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壁立万仞，无欲则刚
2楼2012-04-18 17:38:23
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xiuhui

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chaizhm at 2012-04-18 17:38:23:
取截断半径的目的是为了减少计算量，截断半径以内的才计算。选取的太小了，计算会不准确。

对于非周期性体系，比如有机分子，截断半径要设吗？
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3楼2012-04-19 08:55:42
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-19 09:14:34
xiuhui: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 十分感谢 2012-04-19 09:19:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiuhui at 2012-04-19 08:55:42:
对于非周期性体系，比如有机分子，截断半径要设吗？

有必要啊 截断半径是为了减少计算量的 和周期性没关系

加周期性的话，算两个原子的距离就要考虑周期性的影响，但是周期性只影响距离，和截断半径没关系
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壁立万仞，无欲则刚
4楼2012-04-19 08:58:59
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q1036210267

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
对于非周期性体系，没做过，学习下。帮顶.........
赞一下 回复此楼
生活中坚持快乐的原则不改变，学习工作中踏实上进！`~`
5楼2012-04-19 09:19:29
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