24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2056  |  回复: 14
本帖产生 1 个 BioEPI ,点击这里进行查看

gaoyang636

木虫 (著名写手)

ID那个文件里面多了">",你或者把ID里面的">"删掉,或者直接修改一下脚本即可,简单~

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

11楼2012-04-17 14:29:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
11楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-04-17 14:29:33:
ID那个文件里面多了">",你或者把ID里面的">"删掉,或者直接修改一下脚本即可,简单~

有字母没问题吧 我先试试看哦  谢谢啦
12楼2012-04-17 18:17:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-04-17 14:29:33:
ID那个文件里面多了">",你或者把ID里面的">"删掉,或者直接修改一下脚本即可,简单~

搞定了,谢谢
13楼2012-04-17 19:45:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yinchfa

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-04-15 16:17:07
写了个简单的Perl脚本,需要你电脑中安装有Perl和相应的BioPerl模块;平台不限,Win或者linux都行。
由于不知道你的数据啥样子,也许需要略微修改此脚本,我测试过可以用。
根据提供的id删除相应的序列。
用法: ...

看了您的帖子非常兴奋,果断尝试了以下,很不错

不过,好像不能处理大数据量的文件,比如上十万条。
14楼2012-09-21 11:05:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by yinchfa at 2012-09-21 11:05:26
看了您的帖子非常兴奋,果断尝试了以下,很不错

不过,好像不能处理大数据量的文件,比如上十万条。...

只要是fasta格式的文件,数据量大点应该没有什么问题。
但是Perl不是以速度快和占内存小著称的(也就是Perl又慢又肿);所以如果发现速度奇慢或者其他问题,有几个建议:
1.用Linux 64 运行;
2.在配置较高的机器上运行;
3.换用其他语言处理。
15楼2012-09-21 14:14:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 微笑生活 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +8 xzghyuj 2026-04-04 8/400 2026-04-06 06:47 by houyaoxu
[考研] 机械专硕274求调剂,不挑专业学校 +6 泛泛2333 2026-04-05 7/350 2026-04-05 23:20 by chyhaha
[考研] 生物与医药求调剂 +5 heguanhua 2026-04-05 6/300 2026-04-05 22:58 by Hdyxbekcb
[考研] 318求调剂 +11 ykyhsa 2026-04-05 13/650 2026-04-05 12:44 by aidndnjck
[考研] 290求调剂085701 +10 1314捧花 2026-04-02 10/500 2026-04-05 10:19 by Sealedwind
[考研] 材料调剂 +7 dxy调剂 2026-04-04 7/350 2026-04-05 09:15 by 陌秋26
[考研] 324求调剂 +9 想上学求调 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:57 by 果冻大王
[考研] 26考研调剂0710 0860 +9 补补不补 2026-04-03 14/700 2026-04-04 23:32 by 果冻大王
[考研] 考研调剂 +6 15615482637 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:43 by yu221
[考研] 可跨专业调剂 +3 周的得地 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:21 by barlinike
[考研] 考研调剂 +5 四川王涛 2026-04-04 5/250 2026-04-04 22:18 by 啵啵啵0119
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 341求调剂 +3 洛多罗 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:36 by 智能智慧
[考研] 求调剂 +3 wos666 2026-04-03 3/150 2026-04-04 05:16 by gswylq
[考研] 求调剂机会 +5 意染ivy 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:13 by qoooooo614
[考研] 313求调剂 +3 ~微微凉~ 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:25 by 啵啵啵0119
[考研] 生物学求调剂 +3 15064154688 2026-04-03 3/150 2026-04-03 10:28 by macy2011
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:16 by 兔突突突,
[考研] 298求调剂 +4 什么是胖头鱼 2026-03-30 6/300 2026-04-01 22:06 by 客尔美德
[考研] 293求调剂 +3 末未mm 2026-03-30 5/250 2026-03-30 17:23 by 王保杰33
信息提示
请填处理意见