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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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win雨

银虫 (小有名气)

[求助] 如何确定激酶的gatekeeper残基是哪一个?

看文献里可根据激酶中gatekeeper残基的不同设计选择性的激酶抑制剂,但怎么知道那个是gatekeeper残基呢?希望大家给与指导,或给点相关资料,很着急!
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-04-12 12:50:08
多数是晶体结构解析出来,还有就是经验。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
2楼2012-04-12 11:55:26
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win雨

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tjegg at 2012-04-12 11:55:26:
多数是晶体结构解析出来,还有就是经验。

哦,我还以为通过序列和结构比对就可以看出来呢。我还想请教一下,我想做虚拟筛选,寻找激酶抑制剂,是不是要选DFG-in构象的结构来筛啊?
3楼2012-04-12 20:26:12
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-13 07:43:54
win雨: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-04-13 08:41:36
可以这么做,主要是看活性数据如何,做DFG-in构象,有利于写文章,但是真正实用性并不大。如BCR-ABL的imatinib当初发现就是这样结合模式,但是后来发现的更高活性的化合物是作用于邻近部位,引起活性位点的构象变化。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2012-04-13 06:46:53
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win雨

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tjegg at 2012-04-13 06:46:53:
可以这么做,主要是看活性数据如何,做DFG-in构象,有利于写文章,但是真正实用性并不大。如BCR-ABL的imatinib当初发现就是这样结合模式,但是后来发现的更高活性的化合物是作用于邻近部位,引起活性位点的构象变 ...

谢谢啦,那对于gly-rich loop要怎么处理呀,这段的构象不大一样,不知道选哪个模板?
5楼2012-04-13 08:41:29
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