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舞昂琦VoVo木虫 (小有名气)
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如何在lammps里加入新的势函数形式？
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| 想在lammps里加入一种势函数形式，但看了一下lammps里已有的势函数源代码，感觉比较复杂，有点无从下手，不知道哪位有类似的经验，能够指教一下，万分感激~ |
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lammps现在已经很庞大了，研究其框架可以找比较早期的版本。等大致了解了之后然后在最新版本上进行代码修改。lammps是用c++写的，虽然不算标准的模块化设计，但相对gromacs的代码来说比较模块了，添加一个新的势基本不影响其他的代码。 读代码从main.cpp开始看，了解主要框架，然后重点参考你和你要加势的最像近倒那一类，比如bond_harmonic,pair_lj等。在这个基础上完成自己的修改。一般是2个文件，一个.h，一个.cpp。你需要完成的方法在bond.h,angle.h,pair.h..里面有。 然后还要修改1个文件： style.h，让lammps知道你的势。 然后就make，debug，。。。 |
3楼2012-04-10 00:20:22
【答案】应助回帖
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lammps的势函数已经非常全面了，你仔细遇到以下lammps手册，说不定你想添加的，人家已经有了呢。http://lammps.sandia.gov/doc/Manual.html 如果没有的话，建议你首先把lammps里面的源程序里面的势函数看明白，打个比方说，你想添加一个新的bond style ，那么你把 源程序里面的bond_fene.cpp 和 bond_harmonic.cpp 两个程序看明白了，再去写你想要添加的应该就比较容易了。你还需要弄明白lammps的整个程序框架。 看看这个吧：http://lammps.sandia.gov/doc/Section_modify.html#mod_14 |
2楼2012-04-09 22:25:13
舞昂琦VoVo
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5楼2012-04-10 13:58:00
