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陈年芬芳

新虫 (小有名气)

[求助] 同一个平板上挑的两个菌测序，序列差很多，大家帮我看看啊，有比对图！谢谢啦

4-3-1和4-3-2是一个菌斑摇菌后分装的两管样品测序结果
4-2-1和4-2-2是同一个平板上另一个菌斑摇菌后分装的两管测序结果
91和92是引物。
四个样品的峰图都没有问题
为什么4-3这组和4-2这组的序列差这么多啊？都是同一批的啊。
第一次碰到这种情况，以前也只是二三个碱基的差异，这次差太多了，什么原因啊？
我们这个没有人做，也没法和别人比对。肿么办？
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1楼 2012-04-08 13:57:40
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yingyangyang

木虫 (正式写手)
★ ★
西瓜: 金币+2, Good！ 2012-05-31 09:29:45
要么是你导入的片段有污染或者带有其他不是你想要的片段也导入成功了，成了阳性克隆，你挑出来了。
一般克隆都不会选两个来送测序，我做都是前面克隆多挑十来个，做酶切验证，然后选取一个送测序。  不知道你用的是什么载体，是否对于你挑选阳性克隆有影响。
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15楼2012-05-30 20:47:43
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asdf6074053

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这么低的相似性一定是有???阳性的，为什么??是跟目的??列比对呢？而是他们相互比？而且我感觉如果挑克隆时没问题的??是没必??将???克隆分两管?????独测??的，你的是???在平???上长了多久开始挑的？
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2楼2012-04-09 12:42:50
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asdf6074053

新虫 (初入文坛)
★ ★
西瓜: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-10 18:30:43
不好意思，不知怎么的就乱码了，其实单克隆是没必要分量管单独测序的，除非挑克隆过程就有问题。你是在菌长了多久挑的克隆？
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3楼2012-04-09 12:53:01
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陈年芬芳

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by asdf6074053 at 2012-04-09 12:53:01:
不好意思，不知怎么的就乱码了，其实单克隆是没必要分量管单独测序的，除非挑克隆过程就有问题。你是在菌长了多久挑的克隆？

大概14个小时吧，测两个也是为了有保障，但是为什么两个菌斑的结果差异这么大啊？
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4楼2012-04-09 13:05:33
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