24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 916  |  回复: 2

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[求助] 动力学的平衡状态判定依据只能看RMSD吗?请帮忙看看这个快10ns的结果稳定否,谢谢

请各位帮看看这个稳定了没?AMBER跑的,快10ns,谢谢
没稳定的话,大概需要再跑多久呢? 稳定的话,取哪一段比较好呢?
主要研究小分子和酶的结合构象,谢谢

RMSD



RMSF



EPTOT



DENSITY
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MDs-Gromacs

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

petersen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-04-07 13:48:12
cfmzxf84: 金币+5, 每次都是看着快ok了,再跑个500ps就不稳定了 2012-04-08 20:32:43
可以再跑跑啊!从RMSD看最后几ns稳定在了2.0左右,可以再跑个2-5ns确认后面不会出现急剧上升或下降。
2楼2012-04-07 13:39:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wshzxcc

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-08 08:57:37
cfmzxf84: 金币+5, 就是不知道什么时候能稳定啊,纠结 2012-04-08 20:33:07
趋势来看已经达到稳定了啊
自学成才
3楼2012-04-08 08:53:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cfmzxf84 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工306 +8 z1z2z3879 2026-03-21 8/400 2026-03-27 08:14 by hypershenger
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +5 荷包蛋hyj 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:07 by hypershenger
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-26 4/200 2026-03-27 08:04 by chemisry
[考研] 284求调剂 +11 junqihahaha 2026-03-26 12/600 2026-03-27 04:37 by wxiongid
[考研] 304材料求调剂 +4 钟llll 2026-03-26 4/200 2026-03-27 03:42 by wxiongid
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +6 小小甜面团 2026-03-25 6/300 2026-03-26 23:01 by 不吃魚的貓
[考研] 085701环境工程,267求调剂 +4 minht 2026-03-26 4/200 2026-03-26 20:14 by barlinike
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 化学工程085602 305分求调剂 +17 RichLi_ 2026-03-25 17/850 2026-03-26 19:44 by plmuchong
[考研] 总分293求调剂 +6 加一一九 2026-03-25 8/400 2026-03-26 13:30 by yujianx
[考研] 寻找调剂 +5 倔强芒? 2026-03-21 8/400 2026-03-26 13:25 by 0906ljy
[考研] 0854AI CV方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-23 4/200 2026-03-25 17:04 by CoderLoser
[考研] 材料调剂 +3 iwinso 2026-03-23 3/150 2026-03-25 11:29 by greychen00
[考研] 344求调剂 +3 desto 2026-03-24 3/150 2026-03-24 10:09 by 搏击518
[考研] 生物学一志愿985,分数349求调剂 +6 zxts12 2026-03-21 9/450 2026-03-23 18:37 by macy2011
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
信息提示
请填处理意见