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xiuhui

木虫 (正式写手)

[求助] MS吸附能如何取平均值

如题,我做的是缓蚀剂分子在Fe表面的吸附,跑完动力学之后,输出文件里面的平均能量是整个过程中的平均能量,但是体系稳定之后,也就是100ps以后的平均能量该如何取呢?高人请指点。。。
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sikasun

木虫 (正式写手)


zh1987hs: 金币+1, 鼓励讨论,虽然俺做的是蛋白质的分子动力学模拟,实际上我们都是取平衡后的那一段,倒是没有说最后一段不能取的 2012-04-08 11:37:35
引用回帖:
4楼: Originally posted by 青菜001 at 2012-04-07 12:28:05:
一般的话跑1000ps后100ps不会取,因为状态其实是有起伏的

就是900ps的时候也是有起伏的呀,能量一直是波动的,平衡也是相对的平衡呀
5楼2012-04-08 09:13:56
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青菜001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-07 09:17:32
xiuhui: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 08:24:04
在能量平衡的时间段里随机的取几个时间点,然后求它的吸附能,然后算平均就行了,不过接近结束的一段不要取。
有问题可以私下里探讨,1986319688@qq.com
2楼2012-04-07 09:14:41
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sikasun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 青菜001 at 2012-04-07 09:14:41:
在能量平衡的时间段里随机的取几个时间点,然后求它的吸附能,然后算平均就行了,不过接近结束的一段不要取。

为什么接近结束的一段不要取呢
3楼2012-04-07 09:18:15
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青菜001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-04-07 13:49:19
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-04-08 11:37:43
引用回帖:
3楼: Originally posted by sikasun at 2012-04-07 09:18:15:
为什么接近结束的一段不要取呢

一般的话跑1000ps后100ps不会取,因为状态其实是有起伏的
有问题可以私下里探讨,1986319688@qq.com
4楼2012-04-07 12:28:05
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