| 查看: 344 | 回复: 1 | |||
[求助]
关于受体的active与inactive状态模拟
|
|
假如有一个膜蛋白受体（GPCR），可以结合不同的 agonist（激动剂）与antagonist（拮抗剂）配体，从而介导不同的信号通路，前者使得受体active，后者导致其inactive，在结构上的构象是不同的。现在有这个受体与拮抗剂的复合物晶体，我如何利用这个结构模拟受体与激动剂的结合呢？因为结晶的构象是inactive的啊。求攻略。。。 可不可以将复合物晶体中的拮抗剂去掉，然后跑空载的受体的MD，待稳定了之后再dock激动剂，是不是就比较合理了呢？还是有其他的办法？ 谢谢  |
回复此楼» 猜你喜欢
294求调剂
已经有8人回复
-
324求调剂
已经有14人回复
-
285求调剂
已经有6人回复
-
一志愿上海大学生物学346
已经有3人回复
-
322求调剂：一志愿湖南大学 材料与化工（085600），已过六级。
已经有16人回复
-
调剂
已经有10人回复
-
283求调剂
已经有7人回复
-
0703调剂
已经有6人回复
-
288环境专硕,求调材料方向
已经有6人回复
-
求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Bioactive Foods in Promoting Health 2-Fruits and Vegetables
已经有54人回复
- 应届211、985小硕关于选择上海户口还是农村户口问题？农村户口未来可能拆迁分房子
已经有63人回复
- 关于计划留学日期问题
已经有7人回复
- 关于黄明龙还原酮为亚甲基
已经有31人回复
- 关于一个化合物的合成
已经有12人回复
- 急：关于考研无机化学元素部分复习 方法
已经有7人回复
- 关于磷谱的问题
已经有5人回复
- 关于中文的《分析化学》杂志投稿的若干问题
已经有5人回复
- journal of bioactive and compatible polymers投稿求助！！
已经有8人回复
- 关于显著性差异的分析
已经有8人回复
syhu_007012
木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 5495.1
- 红花: 3
- 帖子: 352
- 在线: 577.2小时
- 虫号: 68086
- 注册: 2005-05-16
- 专业: 药物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-04-02 11:00:09
lovedi: 金币+5 2012-04-02 11:43:22
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-04-02 11:00:09
lovedi: 金币+5 2012-04-02 11:43:22
|
看下这篇文章吧 http://www.pnas.org/content/108/32/13118.abstract 受体从inactive到active需要毫秒级的时间，现在的机器还做不了这个，再等个一二十年估计硬件可以达到这个水平 |
2楼2012-04-02 10:30:58
