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abinit 的几个问题
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新手用abinit 计算，现在遇到了几个问题，请求过来人给予指点。 1，在集群上提交任务的时候，有的时候会出现各个CPU的临时文件的XXX_LOG_00xx,但有的时候不会出现，这是怎么回事？ 在单机上装的串行版本的Abinit计算过程中时候，有一个xxx_STATUS文件，可以实时观察当前的计算进度，从xxx.out文件里面也可以看到类似的计算过程，但是在集群上提交任务的时候，没有出现类似xxx.STATUS的文件可以实时观察当前计算的进程的。把任务提交上去了，显示的在runing，但是没有生成任何的可以观察到当前计算进度的文件，请问这是为什么？ 2，在集群上提交任务的时候，一般设置是这样的： paral_kgb 1 npkpt 12 npspinor 1 npband 1 npfft 1 bandpp 1 有的时候，对输入文件仅仅把 npkpt 的值改变一下，比如由12调成8，计算就类似于无休止了。改制前一个任务3分钟就能完成，改后运行几个小时后还没有结束，请问这是怎么回事？ 3，nstep 的应该设置多少，才合理？每次SCF的循环时间是由什么决定的？ 比如初始我设定60，很快几分钟就运行结束，提示没有收敛，需要提高SCF的循环次数，所以后来设成了100或者更高，重新运行，但是运行又类似于陷入死循环，无休止的很长时间还没有结束。我想问一下，这个SCF每次循环的时间一定吗？相同吗？为什么前面60次的循环一会儿就结束了，而给出结果，后来改成100时，仅仅增加40次就需要花费这么久时间?难道每次的循环时间在逐渐增加？ 4，rprim的设定。在按照例子进行建模的时候，例子提供了acell 和rprim来构建晶胞，在实际应用中，rprim好像不是很直观的得到。比如一些单斜的结构。偶然的一次看到VASP（http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3234667 ）里面在借助MS建模的时候用.cell文件里面的%BLOCK LATTICE_CART 项，由于这一项包括原胞基矢和晶格常数，所以为了方便，就把原胞的晶格常数全部设成1，用这一项作为.in文件中的rprim，我对一个简单的例子进行了测试，发现不是那么管用，计算很长时间了还不收敛，这是为什么？该怎么简单可以从%BLOCK LATTICE_CART里面得到rprim呢？谢谢 |
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没有前辈遇到过这样的情况吗？ 
2楼2012-03-28 13:45:57
