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c_chi

木虫 (正式写手)

[求助] 差分与二次差分电荷密度

我现在需要算一个吸附问题,原子A吸附到结构B上,最终体系为C;
我理解的差分是C的电荷密度减去A和B的电荷密度,可以看出吸附处的吸附和成键情况;而二次差分是C减去C中每个原子的单独的电荷密度。
现在有两个问题:
我理解的两个差分图有错误没有,他们分别可以做什么分析?什么情况下做什么差分?
我想用siesta画出这两个差分图,二次差分直接用输出文件用dentchar处理得到二次差分,差分可以将A B C的结果中的电荷文件相减再画图。是这样处理吗?还是有更简单的方法?或者大家有比较好的matlab脚本去画这两类差分图?或者其他作图方法
先谢谢大家给出帮助了。
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tanxjezh

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

C的自洽电荷密度减去A和B各自的自洽电荷密度,体现的是吸附后B和A之间电荷转移的情况
C自洽电荷密度减去各原子电荷密度之和,可以观察C内部原子成键的情况
春天不是读书天 夏日炎炎正好眠 秋日蚊虫冬日冷 收起书包待来年
3楼2012-07-15 10:36:16
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢指点 2012-03-23 18:46:10
c_chi: 金币+5, ★★★很有帮助, 学习了 2012-03-24 15:43:48
对于你的这个两个差分的用途我也不清楚,一起学习。静等高手解释。

对于那两个差分电荷的做法用denchar可以的。另外感觉用denchar有点麻烦,毕竟需要做输入文件,还有一些参数的定义。实际上可以用rho2cube文件或者grid2cube来做。先做成cube文件。然后对cube文件操作。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2482325&fpage=1
弘德明志博学笃行
2楼2012-03-23 14:49:22
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孙梦瑶199337

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangguangping at 2012-03-23 14:49:22
对于你的这个两个差分的用途我也不清楚,一起学习。静等高手解释。

对于那两个差分电荷的做法用denchar可以的。另外感觉用denchar有点麻烦,毕竟需要做输入文件,还有一些参数的定义。实际上可以用rho2cube文件或 ...

如何用denchar来处理差分电荷呢
4楼2016-12-21 17:08:59
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