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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Linux下怎样使用批处理让任务一个接一个算？
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xuduopeter

新虫 (初入文坛)

[求助] Linux下怎样使用批处理让任务一个接一个算？

看了Windows下用批处理让任务排队算的帖子，那请问在Linux下应该怎么办呢？
恳请前辈们指点啊

@echo on

cd D:\"Materials Studio Projects"\"Ni_Fe_TiC Files"\Documents\"Ni CASTEP Energy"
call C:\"Program Files"\Accelrys\"Materials Studio 5.0"\etc\CASTEP\bin\RunCASTEP -np 2 Ni

cd D:\"Materials Studio Projects"\"Ni_Fe_TiC Files"\Documents\"Ni CASTEP Energy (2)"
call C:\"Program Files"\Accelrys\"Materials Studio 5.0"\etc\CASTEP\bin\RunCASTEP -np 2 Ni

pause


说明：
第一句，@echo on ，目的是显示执行后面的命令，可用@echo off关闭，无所谓。

第二句，D:\"Materials Studio Projects"\"Ni_Fe_TiC Files"\Documents\"Ni CASTEP Energy"，进入到Ni这个任务输入文件所在的目录，注意文件夹带空格的要整体用""引起来，具体位置当然看个人而定。

第三句，C:\"Program Files"\Accelrys\"Materials Studio 5.0"\etc\CASTEP\bin\RunCASTEP -np 2 Ni，调用RunCASTEP程序用2个核跑任务Ni，后面的类推。


   这里要注意的是，这个目录是MS默认的安装路径，如果不是默认安装要做相应改正，这个大家找找看就是了。在Win下，虽然有RunCASTEP.bat，RunCASTEP.Readme，但是在批处理调用的时候不要带上扩展名，直接用RunCASTEP即可。同样，任务名也是这样处理的，依照保存在Ni CASTEP Energy文件夹中的任务名决定。

最后一句，pause，直接执行计算完后窗口会直接关闭，用pause语句，计算完后出现“按任意键继续...”，可以使窗口保持打开状态，当然此时任务也都已经算完了，窗口打开与否对任务没有影响、

OK，找到这个批处理文件，双击执行。


这是前人Windows下的批处理
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1楼 2012-03-22 22:20:02
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xuduopeter

新虫 (初入文坛)
批处理成功了  就写了简单两句话
/home/zjx/MaterialsStudio/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 16 a
/home/zjx/MaterialsStudio/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 16 b

但也出现了问题  RunDMol3.sh中如下这段代码没有执行
    clean_scratch() {
       #Remove any scratch files
       echo "cleaning scratch files"
       for ext in rot tpotl tmesh tpsmx optabs basis \
            grad inatm incoor opt outatom pchk \
               symdec symdv sym torder tpdiis tpdiisk tplev1 \
               tplev2 fwv amat prf monitor tphmx tpeig
       do
          [ -f $rootname.$ext ] && rm $rootname.$ext
       done
   
       rm -f *.pid
    }

也就是说a.tpotl   a.tmesh   a.tpsmx   a.optabs等 算完后本应该删掉的文件没有自动删除
屏幕上提示  ** Address Error **
另：自己写的批处理文件和等待计算的文件都放在  /home/xuduo/文件夹中
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我不个性，我不签名。
10楼2012-03-24 15:40:28
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢指教 2012-03-23 07:32:44
xuduopeter: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-03-27 08:30:00
linux下面一样吧。只要不加&，都是前一个算完后一个才算的。linux的脚本扩展名是sh，执行的时候用sh *.sh。
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2楼2012-03-23 00:06:05
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xuduopeter

新虫 (初入文坛)
那请问批处理文件中还能用 call 命令吗  还是将call改为sh
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我不个性，我不签名。
3楼2012-03-23 00:26:26
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-03-23 12:10:45
sunyang1988: 专家考核 2012-03-23 12:11:00
xuduopeter: 金币+2, ★有帮助 2012-03-27 08:29:42
引用回帖:
3楼: Originally posted by xuduopeter at 2012-03-23 00:26:26:
那请问批处理文件中还能用 call 命令吗  还是将call改为sh

不用call，只要保证RunCASTEP.sh的权限是可执行的就OK了
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思想重于技巧，内涵重于表象
4楼2012-03-23 11:44:32
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