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xuduopeter

新虫 (初入文坛)

[求助] Linux下怎样使用批处理让任务一个接一个算?

看了Windows下用批处理让任务排队算的帖子,那请问在Linux下应该怎么办呢?
恳请前辈们指点啊

@echo on

cd D:\"Materials Studio Projects"\"Ni_Fe_TiC Files"\Documents\"Ni CASTEP Energy"
call C:\"Program Files"\Accelrys\"Materials Studio 5.0"\etc\CASTEP\bin\RunCASTEP -np 2 Ni

cd D:\"Materials Studio Projects"\"Ni_Fe_TiC Files"\Documents\"Ni CASTEP Energy (2)"
call C:\"Program Files"\Accelrys\"Materials Studio 5.0"\etc\CASTEP\bin\RunCASTEP -np 2 Ni

pause


说明:
第一句,@echo on ,目的是显示执行后面的命令,可用@echo off关闭,无所谓。

第二句,D:\"Materials Studio Projects"\"Ni_Fe_TiC Files"\Documents\"Ni CASTEP Energy",进入到Ni这个任务输入文件所在的目录,注意文件夹带空格的要整体用""引起来,具体位置当然看个人而定。

第三句,C:\"Program Files"\Accelrys\"Materials Studio 5.0"\etc\CASTEP\bin\RunCASTEP -np 2 Ni,调用RunCASTEP程序用2个核跑任务Ni,后面的类推。


   这里要注意的是,这个目录是MS默认的安装路径,如果不是默认安装要做相应改正,这个大家找找看就是了。在Win下,虽然有RunCASTEP.bat,RunCASTEP.Readme,但是在批处理调用的时候不要带上扩展名,直接用RunCASTEP即可。同样,任务名也是这样处理的,依照保存在Ni CASTEP Energy文件夹中的任务名决定。

最后一句,pause,直接执行计算完后窗口会直接关闭,用pause语句,计算完后出现“按任意键继续...”,可以使窗口保持打开状态,当然此时任务也都已经算完了,窗口打开与否对任务没有影响、

OK,找到这个批处理文件,双击执行。


这是前人Windows下的批处理
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

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★ ★ ★ ★ ★
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liliangfang: 金币+1, 谢谢指教 2012-03-23 07:32:44
xuduopeter: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-03-27 08:30:00
linux下面一样吧。只要不加&,都是前一个算完后一个才算的。linux的脚本扩展名是sh,执行的时候用sh *.sh。
2楼2012-03-23 00:06:05
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xuduopeter

新虫 (初入文坛)

那请问批处理文件中还能用 call 命令吗  还是将call改为sh
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3楼2012-03-23 00:26:26
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souledge

专家顾问 (著名写手)

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★ ★ ★
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sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-03-23 12:10:45
sunyang1988: 专家考核 2012-03-23 12:11:00
xuduopeter: 金币+2, 有帮助 2012-03-27 08:29:42
引用回帖:
3楼: Originally posted by xuduopeter at 2012-03-23 00:26:26:
那请问批处理文件中还能用 call 命令吗  还是将call改为sh

不用call,只要保证RunCASTEP.sh的权限是可执行的就OK了
思想重于技巧,内涵重于表象
4楼2012-03-23 11:44:32
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xuduopeter

新虫 (初入文坛)

好的 我试试
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5楼2012-03-23 15:21:59
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xuduopeter

新虫 (初入文坛)

我是这么写的  但提示权限不够
cd /home/xuduo
/home/jxzMaterialsStudio/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 16 quexian-PtFe3-c-1
cd /home/xuduo
/home/jxzMaterialsStudio/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 16 quexian-PtFe3-c-2
pause
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6楼2012-03-23 15:33:27
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wufengseu

木虫 (正式写手)

★ ★
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-03-23 16:16:22
引用回帖:
6楼: Originally posted by xuduopeter at 2012-03-23 15:33:27:
我是这么写的  但提示权限不够
cd /home/xuduo
/home/jxzMaterialsStudio/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 16 quexian-PtFe3-c-1
cd /home/xuduo
/home/jxzMaterialsStudio/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 16 quexian- ...

先  chmod +x RunDMol3.sh
7楼2012-03-23 15:57:46
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
uuv2010: 金币+1, 多谢指导 2012-03-23 17:30:06
xuduopeter: 金币+1, 有帮助 2012-03-27 08:30:43
另外不用pause,算完自己就停了。
8楼2012-03-23 16:54:15
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lbbz323

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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贺仪: 金币+1, 谢谢参与讨论 2012-03-24 10:12:18
xuduopeter: 金币+1, 有帮助 2012-03-27 08:31:16
一个运行的命令,接着往下排列就是了。
9楼2012-03-23 23:21:52
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xuduopeter

新虫 (初入文坛)

批处理成功了  就写了简单两句话
/home/zjx/MaterialsStudio/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 16 a
/home/zjx/MaterialsStudio/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 16 b

但也出现了问题  RunDMol3.sh中如下这段代码没有执行
    clean_scratch() {
       #Remove any scratch files
       echo "cleaning scratch files"
       for ext in rot tpotl tmesh tpsmx optabs basis \
            grad inatm incoor opt outatom pchk \
               symdec symdv sym torder tpdiis tpdiisk tplev1 \
               tplev2 fwv amat prf monitor tphmx tpeig
       do
          [ -f $rootname.$ext ] && rm $rootname.$ext
       done
   
       rm -f *.pid
    }

也就是说a.tpotl   a.tmesh   a.tpsmx   a.optabs等 算完后本应该删掉的文件没有自动删除
屏幕上提示  ** Address Error **
另:自己写的批处理文件和等待计算的文件都放在  /home/xuduo/文件夹中
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10楼2012-03-24 15:40:28
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