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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 得到DNA片段，如何推测产物
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shuangzi8761

银虫 (著名写手)

[求助] 得到DNA片段，如何推测产物

小弟实验中得到了一个基因的部分片段，想要推测基因的表达产物，求教如何操作？
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1楼 2012-03-21 16:52:17
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若水5886

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你可以在NCBI中进行DNA 的blast，看看它与其它核酸的比对结果
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9楼2012-03-22 10:12:34
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gaowei706

铁杆木虫 (职业作家)

资深潜水者

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
先到NCBI等数据库中进行BLAST检索，找到与你的DNA序列相似性最高的序列，根据它的注释分析你的序列产物
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逐渐失去棱角
10楼2012-03-22 10:28:55
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普通回帖

bbwalkman

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你在NCBI里搜索一下可以么，或者说给他加上一段启动子表达一下检测一下蛋白呢
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2楼2012-03-21 19:47:03
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bbwalkman

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

把它加入到载体里面 看看表达出来是什么蛋白
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3楼2012-03-21 19:48:02
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shuangzi8761

银虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by bbwalkman at 2012-03-21 19:48:02:
把它加入到载体里面 看看表达出来是什么蛋白

我拿到的只是部分片段 而且相关实验已经验证了表达产物不是蛋白
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4楼2012-03-21 20:34:47
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bbwalkman

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不是蛋白那是什么 多肽 还是形成RNAi
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5楼2012-03-21 20:47:32
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shuangzi8761

银虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by bbwalkman at 2012-03-21 20:47:32:
不是蛋白那是什么 多肽 还是形成RNAi

不知道呢。。。就是想推测下表达什么。。。用蛋白酶K，胰蛋白酶，胃蛋白酶处理过了，活性没有降低。。。。
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6楼2012-03-21 21:00:53
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bbwalkman

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

按理说要是蛋白的话应该是有消化啊 确定表达是么？
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7楼2012-03-21 21:19:53
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shuangzi8761

银虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by bbwalkman at 2012-03-21 21:19:53:
按理说要是蛋白的话应该是有消化啊 确定表达是么？

恩 对 现在考虑到可能涉及基因簇或者是基因岛 不是单个基因的问题 而且我拿到的是部分片段 想先推测下产物。。。。有没有什么软件或者在Blast可以操作的方法？？？
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8楼2012-03-22 09:26:39
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