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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请大家帮我看看SSR的聚丙烯~
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鹫羽0711

新虫 (初入文坛)

[求助] 请大家帮我看看SSR的聚丙烯~

大家帮忙看看我的聚丙烯啊~~琼脂糖跑的很漂亮的才会跑聚丙烯的，但是跑出来却是这样子，相关疑问：
1、顶端问什么也有带？感觉像是没跑下来~
2、琼脂糖有条带的聚丙烯没有或者拖带杂带严重，有的是琼脂糖没条带的，聚丙烯有，还有拖带
3、我的电泳120V跑了四个小时才跑了2/3，时间也太长了吧？

拜托各位指点，谢谢了~
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1楼 2012-03-21 09:59:07
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
帮顶
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2楼2012-03-21 17:09:37
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助，很热心哦 2012-03-22 13:30:46
顶端的可能是模版DNA，最下班的可能是引物二聚体。出现杂带有可能是为点或是个体等位基因的表现或是杂合个体。如果你可以排除PCR扩增条件上的问题（非特异扩增），那就应该是前面所说的情况。建议你把每个胶空的情况标出，而且看看相关文章中该locus的遗传多样性有多高，表观杂合度和期望杂合度，对你分析这个可能有帮助。
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将相本无种★男儿当自强
3楼2012-03-21 21:37:40
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, Good!专家啊！ 2012-03-25 14:23:41
再补充一下，以我的经验，SSR跑电泳的时候，要想分辨率好，一般采用低熔点胶，那个分辨率更好，不过操作比较麻烦。跑电泳时间过长，缓冲液温度升高，也会产生不良影响，建议你将部分电泳缓冲液事先冻成冰块，在跑胶的过程中放入，一是可以填补缓冲液，另外可以降低温度，希望对你有帮助。
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将相本无种★男儿当自强
4楼2012-03-21 21:40:54
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河
从你胶孔的亮度来看，你的模版加入量过高，建议稀释。
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将相本无种★男儿当自强
5楼2012-03-21 21:42:30
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鹫羽0711

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by rommel1941 at 2012-03-21 21:42:30:
从你胶孔的亮度来看，你的模版加入量过高，建议稀释。

谢谢~~那拖带的情况是怎么个意思嘞？总感觉跑不干净，拖拖拉拉的实在不好看啊~~
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6楼2012-03-23 09:57:29
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河
★ ★
西瓜: 金币+2, 鼓励 2012-03-25 14:23:50
试试更换缓冲液，抑或先从降低模板浓度下手
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将相本无种★男儿当自强
7楼2012-03-24 09:03:31
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鹫羽0711

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by rommel1941 at 2012-03-24 09:03:31:
试试更换缓冲液，抑或先从降低模板浓度下手

感激不尽！呵呵~
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8楼2012-03-24 15:26:17
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