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鹫羽0711

新虫 (初入文坛)

[求助] 请大家帮我看看SSR的聚丙烯~

大家帮忙看看我的聚丙烯啊~~琼脂糖跑的很漂亮的才会跑聚丙烯的,但是跑出来却是这样子,相关疑问:
1、顶端问什么也有带?感觉像是没跑下来~
2、琼脂糖有条带的聚丙烯没有或者拖带杂带严重,有的是琼脂糖没条带的,聚丙烯有,还有拖带
3、我的电泳120V跑了四个小时才跑了2/3,时间也太长了吧?

拜托各位指点,谢谢了~



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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助,很热心哦 2012-03-22 13:30:46
顶端的可能是模版DNA,最下班的可能是引物二聚体。出现杂带有可能是为点或是个体等位基因的表现或是杂合个体。如果你可以排除PCR扩增条件上的问题(非特异扩增),那就应该是前面所说的情况。建议你把每个胶空的情况标出,而且看看相关文章中该locus的遗传多样性有多高,表观杂合度和期望杂合度,对你分析这个可能有帮助。
将相本无种★男儿当自强
3楼2012-03-21 21:37:40
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, Good!专家啊! 2012-03-25 14:23:41
再补充一下,以我的经验,SSR跑电泳的时候,要想分辨率好,一般采用低熔点胶,那个分辨率更好,不过操作比较麻烦。跑电泳时间过长,缓冲液温度升高,也会产生不良影响,建议你将部分电泳缓冲液事先冻成冰块,在跑胶的过程中放入,一是可以填补缓冲液,另外可以降低温度,希望对你有帮助。
将相本无种★男儿当自强
4楼2012-03-21 21:40:54
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

从你胶孔的亮度来看,你的模版加入量过高,建议稀释。
将相本无种★男儿当自强
5楼2012-03-21 21:42:30
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鹫羽0711

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by rommel1941 at 2012-03-21 21:42:30:
从你胶孔的亮度来看,你的模版加入量过高,建议稀释。

谢谢~~那拖带的情况是怎么个意思嘞?总感觉跑不干净,拖拖拉拉的实在不好看啊~~
6楼2012-03-23 09:57:29
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