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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 一个B类错误，查了很多资料了，还是不知道怎么解决，请高手指点下
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shujian123

银虫 (小有名气)

[求助] 一个B类错误，查了很多资料了，还是不知道怎么解决，请高手指点下

Alert level B
PLAT601_ALERT_2_B Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .  122 A**3

我看了很多资料，坛子里的帖子也搜索了一个晚上
还是不知道怎么解决好点

这个问题好像是结构解析的问题
坛子里有朋友说是用PLANTON中的程序处理，有朋友说是解释下就行

我这里没装PLANTON这个软件，如果解释的话，这样说行吗？
“然结构具有很大的空间，但是窗口很小，客体分子挤不进去那个空的地方。”

像这样的错误投什么杂志可以啊？像ACTA E能投吗？

望高手不吝赐教！
拜谢了@
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1楼 2012-03-20 23:13:09
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superliky

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by shujian123 at 2012-03-21 09:26:54:
我现在用platon 中的squeeze 程序运行了下
把生成的sqf文件中的loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
...

加进去后，应该没有你说的那个错误了。
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7楼2012-03-21 10:52:49
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superliky

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lijunjie84: 金币+1, 感谢应助！ 2012-03-20 23:39:09
shujian123: 金币+8, ★★★很有帮助 2012-03-21 07:22:48
shujian123: 金币+10 2012-04-03 00:57:24
如果你在晶体解析过程中，使用过squeeze，那么就将相关信息放在CIF后面。
如果没有使用squeeze，就是说，你的结构中空间挺大的，你解析解析就好了。
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2楼2012-03-20 23:22:54
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r2rr2r

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shujian123: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-03-21 07:22:59
lichun1210: 金币+1, 感谢回帖交流~ 2012-03-21 08:13:43
shujian123: 金币+18 2012-04-03 00:57:28
晶体中有空洞。有这样几个原因：
1 有部分溶剂分子没找全。请多放一些q峰出来修溶剂分子即可
2 就有有空洞。结构还能稳定，多出现在一些具有稳定三维结构的配位聚合物中。这种一般在文章中说明晶体中有多大的孔洞就可以了，溶剂分子为什么进不去的原因很多，一般用不着说明。这种是可以接受的。而且有可能做气体吸附和溶剂交换哦。
不过以上两种情况都最好能有热重分析数据来佐证其中溶剂分子的含量。
Acta E连SCI源刊都不是，而且出过学术不端的大问题，一般能避免就避免。
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3楼2012-03-21 00:29:39
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shujian123

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by superliky at 2012-03-20 23:22:54:
如果你在晶体解析过程中，使用过squeeze，那么就将相关信息放在CIF后面。
如果没有使用squeeze，就是说，你的结构中空间挺大的，你解析解析就好了。

我看了CIF文件 好像没有运行过这个程序
这样的话要修结构是不是必须用PLATON 这个程序啊？
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4楼2012-03-21 07:21:58
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