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896103949

铁虫 (正式写手)

[求助] 求助用planton帮我计算p-p堆积作用的距离?

p-p堆积作用的距离的表示方法,我是用diamond在产生p-p堆积作用的两个苯环中插入两个原子,然后量下他们的距离就得到了他们之间的质心。不知道跟planton计算出来结果一样不一样?
ps:planton我没用过,我们只用diamond画图
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knight1014

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lichun1210: 金币+1, 专家考核, 感谢回帖交流~ 2012-03-19 08:00:40
896103949: 金币+5, ★★★很有帮助, 能快点帮忙看看不? 2012-03-19 09:13:43
把CIF发到我邮箱,我抽空给你看一下。knight1014@163.com
5楼2012-03-19 02:10:00
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普通回帖

jjxiang

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
lichun1210: 金币+1, 感谢回帖交流~ 2012-03-18 22:05:09
Diamond也可以啊···添加两个面,计算面之间的距离!
下一步,做自己!!
2楼2012-03-18 21:24:49
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wutao845233

至尊木虫 (著名写手)

这个得看连线与苯环所成的角度,如果成90度那连线的距离可以认为是垂直距离
3楼2012-03-18 22:59:14
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gaiyanlide

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
lichun1210: 金币+1, 感谢回帖交流~ 2012-03-19 08:00:29
根据我的经验,platon计算出来的距离和dimond中的有些不一样
4楼2012-03-18 23:21:45
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896103949

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jjxiang at 2012-03-18 21:24:49:
Diamond也可以啊···添加两个面,计算面之间的距离!

你的意思我明白,是在两个所在原子平面加个plane,然后测他们之间的垂直距离。
6楼2012-03-19 08:42:14
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896103949

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wutao845233 at 2012-03-18 22:59:14:
这个得看连线与苯环所成的角度,如果成90度那连线的距离可以认为是垂直距离

两个平面成90°的话,谈不上有p-p堆积吧
7楼2012-03-19 08:54:08
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jjxiang

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 896103949 at 2012-03-19 08:54:08:
两个平面成90°的话,谈不上有p-p堆积吧

这种堆积方式有很多种!成九十度的也有·····
下一步,做自己!!
8楼2012-03-19 09:01:02
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896103949

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by jjxiang at 2012-03-19 09:01:02:
这种堆积方式有很多种!成九十度的也有·····

请问你会用platon软件吗?能找出p-p堆积之间的距离乎?帮我个忙
9楼2012-03-19 09:06:25
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knight1014

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

Cg(2)  [ 1] -> Cg(2)  [  4545.01]  5.7556(18) -0.5857-0.1297-0.8001  -4.4118        15 55.90 70.30   1.9404(7)   3.2272(7)
Cg(2)  [ 1] -> Cg(2)  [  5565.01]  4.8831(16) -0.5857 0.1297-0.8001   2.3727         0 44.90 44.90  -3.4586(7)  -3.4587(7)   3.447
Cg(2)  [ 1] -> Cg(2)  [  6555.01]  5.1026(16)  0.5857-0.1297-0.8001  -2.5866        74 20.81 88.12  -0.1673(7)   4.7698(7)
根据以上数据,可以认为不存在派-派作用,因为质心距离超过4.6埃,也就不用考虑了。
10楼2012-03-19 21:30:31
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