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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求助怎么辨别晶体那个做的好
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山石岩

金虫 (著名写手)

[求助] 求助怎么辨别晶体那个做的好

新手一枚，培养的单晶送了两次，不知道那个晶体解析的好。应该怎么看那个比较好呢？
我的化合物分子式本应该是C28H22ClF4N3O2,溶剂是丙酮但是给出的分子式确是C121 H102 Cl4 F16 N12 O11，这样的晶体能发晶体E吗？应该怎么修改呢？
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1楼 2012-03-15 21:11:15
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山石岩

金虫 (著名写手)
PS：我用了cifcheck 中有B 类错误如下，应该怎么解决？各位大侠帮看看
PLAT413_ALERT_2_B Short Inter XH3 .. XHn     H47B   ..  H60A    ..       2.07 Ang.
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2楼2012-03-15 21:14:09
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lichun1210: 金币+2, 感谢回帖交流~ 2012-03-16 09:23:08
山石岩: 金币+10, ★有帮助 2012-03-16 17:06:03
lijunjie84: 金币+1, 欢迎回帖交流！ 2012-03-18 13:02:38
你的这个B类问题，我认为如果有氢键存在，应该是可以容忍的，不算是错误。
你的分子式在checkcif时候，没有发现任何相关的错误，就应该没有问题，不需要修改。

只要你的晶体结构是新的，R值也足够小（一般小于7%），发晶体E没问题。
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老歪博
3楼2012-03-16 03:47:51
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山石岩

金虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by p452_1 at 2012-03-16 03:47:51:
你的这个B类问题，我认为如果有氢键存在，应该是可以容忍的，不算是错误。
你的分子式在checkcif时候，没有发现任何相关的错误，就应该没有问题，不需要修改。

只要你的晶体结构是新的，R值也足够小（一般小于 ...

弱弱的问下R是指哪个？
_refine_diff_density_rms    0.064   是这个吗？
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4楼2012-03-16 09:22:45
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)
★
lijunjie84: 金币+1 2012-03-18 13:02:51
引用回帖:
4楼: Originally posted by 山石岩 at 2012-03-16 09:22:45:
弱弱的问下R是指哪个？
_refine_diff_density_rms    0.064   是这个吗？

结构解析的好坏由2个标准R1 和 wR2。一般R1要求小于0.07， wR2要小于0.25. 不是你上头指的那个东西。
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山石岩
老歪博
5楼2012-03-16 16:29:13
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山石岩

金虫 (著名写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by p452_1 at 2012-03-16 16:29:13:
结构解析的好坏由2个标准R1 和 wR2。一般R1要求小于0.07， wR2要小于0.25. 不是你上头指的那个东西。

能具体告知一下在哪吗数据太多已经迷茫了
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6楼2012-03-16 17:02:38
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
lijunjie84: 金币+1 2012-03-18 13:02:58
一个具体的例子：
在你的cif文件里，你会发现几行数据像
_refine_ls_R_factor_all           0.0604
_refine_ls_R_factor_gt            0.0414
_refine_ls_wR_factor_ref          0.0955
_refine_ls_wR_factor_gt           0.0887
_refine_ls_goodness_of_fit_ref    1.044
_refine_ls_restrained_S_all       1.044
_refine_ls_shift/su_max           0.000
_refine_ls_shift/su_mean          0.000
结构解析的好坏要求R1（上头2行）小于0.07， wR2要小于0.25（相邻2行）。另外goodness_of_fit趋近于1，精修的偏差要趋近于0（最下2行）。
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老歪博
7楼2012-03-16 18:24:41
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)
★
lijunjie84: 金币+1 2012-03-18 13:03:05
引用回帖:
6楼: Originally posted by 山石岩 at 2012-03-16 17:02:38:
能具体告知一下在哪吗数据太多已经迷茫了

如果你没有找到，请把cif文件发给我，我帮助你找到它们。我的联系是：fshi@ua.pt
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老歪博
8楼2012-03-16 18:27:27
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山石岩

金虫 (著名写手)
lijunjie84: , 这个虫子，人家连续回答你这么多问题了，你为什么不把cif发人看下呢，这样给人感觉你不相信人家哦 2012-03-18 13:05:01
引用回帖:
7楼: Originally posted by p452_1 at 2012-03-16 18:24:41:
一个具体的例子：
在你的cif文件里，你会发现几行数据像
_refine_ls_R_factor_all           0.0604
_refine_ls_R_factor_gt            0.0414
_refine_ls_wR_factor_ref          0.0955
_refine_ls_wR ...

_refine_ls_R_factor_all           0.0805
_refine_ls_R_factor_gt            0.0708
_refine_ls_wR_factor_ref          0.2004
_refine_ls_wR_factor_gt           0.1892
_refine_ls_goodness_of_fit_ref    1.042
_refine_ls_restrained_S_all       1.109
_refine_ls_shift/su_max           0.000
_refine_ls_shift/su_mean          0.000
你好，这样的数据能发晶体E吗？
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9楼2012-03-18 12:50:09
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 山石岩 at 2012-03-18 12:50:09:
_refine_ls_R_factor_all           0.0805
_refine_ls_R_factor_gt            0.0708
_refine_ls_wR_factor_ref          0.2004
_refine_ls_wR_factor_gt           0.1892
_refine_ls_goodness_of_f ...

对的。就是以上数据。你的R1=0.0708, 稍微大一些，也可以发表了。其他数值都很好了。
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山石岩
老歪博
10楼2012-03-18 16:15:26
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