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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Turbomole/ORCA » 请教：orca 中用CCSD(T)计算单点能出错--提示内存不足 该怎么办？
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stewart1922

至尊木虫 (职业作家)

[求助] 请教：orca 中用CCSD(T)计算单点能出错--提示内存不足 该怎么办？ 已有1人参与

如果加内存 该用什么命令呢？出错信息附在后面

很急 多谢赐教

-------------------------------------------------------------------------------
                              ORCA-MATRIX DRIVEN CI
-------------------------------------------------------------------------------

--------------------------------
AUTOMATIC CHOICE OF INCORE LEVEL
--------------------------------

Memory available         ...    256.00 MB
Memory needed for S+T    ...   4073.60 MB
Memory needed for J+K    ...   8153.60 MB
Memory needed for DIIS   ...  57030.38 MB
Memory needed for 3-ext  ...  25588.23 MB
Memory needed for 4-ext  ... 123579.54 MB
-> Final InCoreLevel    ... 0
Error (ORCA_MDCI): not enough memory for computing triples
  => Memory needed    :   2907.75 MB
  => Memory available :    256.00 MB
Process 0:       ... aborting the job
Process 0:       ... aborting the job
--------------------------------------------------------------------------
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 12.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 0 with PID 5189 on
node node143 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
[node143:05188] 7 more processes have sent help message help-mpi-btl-openib.txt / no active ports found
[node143:05188] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages

An error has occured in the MDCI module
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1楼 2012-03-15 18:24:39
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

nwwolfchj

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
%MaxCore 250000

前提是你内存有250GB，我觉的不现实，要不换方法和基组，要不换软件。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2012-03-16 02:11:57
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普通回帖

chrinide

木虫 (正式写手)
我晕 你算啥玩意啊

Memory needed for 4-ext  ... 123579.54 MB

要100多G的内存啊

你有这么多内存吗？
赞一下 回复此楼
未知必须借由更深的未知去获悉，隐晦必须借由更深的隐晦来明了
2楼2012-03-15 20:52:14
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nwwolfchj

金虫 (正式写手)
补充一点，还可把积分往硬盘上写，而不是内存上。
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4楼2012-03-16 02:13:12
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stewart1922

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by nwwolfchj at 2012-03-16 02:13:12:
补充一点，还可把积分往硬盘上写，而不是内存上。

请教您 怎么把积分写到硬盘上？
赞一下 回复此楼
5楼2012-03-16 09:24:26
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nwwolfchj

金虫 (正式写手)
看手册，具体我也不太清楚，我只是个根据经验告诉你，我没用过ORCA的CCSD(T)，还有一种方式就是用RI型基组，我也没用过，但看过文献和帖子了解的。你看手册尝试一下。
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6楼2012-03-18 07:35:46
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tudoudigua

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
方法有二：
一：%nproc=4
      %mem=6gb
      %chk=。。。。。
      基组方法
二：直接在基组方法后面加上iop(/9/16=16) maxdisk=20gb
    如果仍然不行，可以调节iop(9/16=14,12......)
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人生总是在习惯那些不习惯的习惯！
7楼2012-03-19 08:55:41
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tudoudigua

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

%nproc=8 (这个数字是你的一个节点能够提供多少核有关，要是8核就是%nproc=8、、、、、
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人生总是在习惯那些不习惯的习惯！
8楼2012-03-19 08:57:13
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jiangning198511

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by tudoudigua at 2012-03-19 08:55:41
方法有二：
一：%nproc=4
      %mem=6gb
      %chk=。。。。。
      基组方法
二：直接在基组方法后面加上iop(/9/16=16) maxdisk=20gb
    如果仍然不行，可以调节iop(9/16=14,12......)

这是高斯吧
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9楼2013-12-20 11:00:11
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jiangning198511

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

首先，你的体系有多大，基函数大于400的话，CCSD（T）就非常满了。

其二，你的设置有点问题，ORCA的内存是每个核的，如果要用8个核，要用32GB的话，就设置为4000即可，你的250GB设置太大了。
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10楼2013-12-20 11:03:51
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