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mahoumeimei

金虫 (小有名气)

[求助] RNA电泳

各位,我的RNA电泳结果很差,是降解了吗?(最左边是生工的100bp DNA ladder)我是刚提完就跑的电泳,是提取过程中操作不当吗?

RNA电泳
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zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
30楼: Originally posted by 神经再生 at 2012-03-15 21:09:33:
图不用说,很帅,最下面颜色暗暗的,能否解释一下什么情况么

我提得是原核细菌的total RNA,用来进行RNA-seq,对RNA的质量要求较高,RIN值要求比较严格。如果是普通的反转录调取基因,只要能扩增出来即可(但一定要注意消化DNA)。

我用的是普通跑DNA电泳的设备,500伏跑了不到10分钟。前面较暗的条带是loading buffer中的溴酚蓝。
我有一个梦想,我梦想有一天,我们的人民可以根据自己的意愿与消费能力,居住在自己愿意居住的地方。
32楼2012-03-16 08:32:14
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karin

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mahoumeimei(金币+2): 2012-03-12 20:05:20
你提取的RNA量太低而且降解严重。正常RNA电泳应该有28s、18s、5s三条带,28s的带的亮度约是18s带的两倍,最低也得等同,一般提取情况下5s的带很少见。你的RNA基本都降解了,建议认真彻底处理提取用具及环境!
坚持就是胜利
2楼2012-03-12 12:29:14
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mahoumeimei

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by karin at 2012-03-12 12:29:14:
你提取的RNA量太低而且降解严重。正常RNA电泳应该有28s、18s、5s三条带,28s的带的亮度约是18s带的两倍,最低也得等同,一般提取情况下5s的带很少见。你的RNA基本都降解了,建议认真彻底处理提取用具及环境!

我提取用的枪头是买的一次性的,实验台和移液枪都喷了酒精了,实验过程中都带着口罩和干净手套,求教还有哪里可能没注意到啊?急!急!急!
3楼2012-03-12 15:00:57
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karin

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木(金币+2): 鼓励 2012-03-13 10:30:25
mahoumeimei: 金币+1 2012-03-27 11:28:42
引用回帖:
3楼: Originally posted by mahoumeimei at 2012-03-12 15:00:57:
我提取用的枪头是买的一次性的,实验台和移液枪都喷了酒精了,实验过程中都带着口罩和干净手套,求教还有哪里可能没注意到啊?急!急!急!

跑电泳的东西也是要处理的。我以前是用试剂盒提取的,所用的管子和枪头也都是买的去RNase的,把制胶的模具和电泳槽用DEPC处理,提取过程尽量迅速,效果还是不错的。你是提取的甚么的RNA呢?
    祝实验成功!
坚持就是胜利
4楼2012-03-12 17:08:26
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