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遥望87

银虫 (小有名气)

[求助] PCR扩增结果

最近在扩增某基因的中间片段,刚开始时PCR结果经电泳检测有条带,后来在相同的条件下(PCR反应条件、cDNA及所用的试剂均一样)却怎么也扩不出来了,是引物的问题吗?(引物为简并引物,另外cDNA已用内参检验过,没有问题)。该问题已困扰鄙人很久了,望高手指点。非常感谢!
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超然渡陈

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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遥望87: 金币+4, ★★★很有帮助, 谢谢! 2012-04-18 16:19:39
cDNA很容易降解的,虽然是放在-40℃,但是冰箱门经常开关的话几天之内也是会有降解,而且反复冻融几次也肯定有降解。最好是在逆转录之后把cDNA分装成几分,常用的那份放在-40℃,其它放在-80℃冻存。你可以再用你的体系检测内参看看是否是cDNA的原因。PCR结果不能重复有很多原因的。比如几次加样时使用枪头不是一批吸附性不同,PCR仪中放置在不同的孔中温度有波动以及升降温时间有差异,同一个公司同一种酶不同批号之间活性会有差异,PCR用水可以直接用双蒸水或者超纯水,灭过菌之后会变酸性等等。可以设计一个方案一一排除。或者为了省时间可以直接一套全换新的。
11楼2012-03-29 10:34:03
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panda73

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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西瓜(金币+1): 设置正确的对照很重要! 2012-03-09 23:46:56
遥望87(金币+3): 有帮助 谢谢! 2012-03-11 10:12:24
建议你将内参的扩增和目的基因片度的扩增同时进行,设置阴性和阳性对照是发现问题的最好办法
2楼2012-03-09 07:59:48
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szylnl

银虫 (小有名气)

是不是cDNA时间长了啊
用百分之百的努力去做每件事
3楼2012-03-09 08:57:42
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遥望87

银虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by szylnl at 2012-03-09 08:57:42:
是不是cDNA时间长了啊

不会吧,中间也就只隔两三天,而且cDNA一直都放在-40的冰箱里的
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4楼2012-03-09 10:29:59
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